Trong quá trình hoạt động sản xuất kinh doanh, việc sai sót trong kê khai thuế hay vô tình bỏ sót hóa đơn đầu vào là điều khó tránh khỏi đối với các kế toán viên, đặc biệt là trong những kỳ quyết toán bận rộn. Tuy nhiên, thay vì lo lắng về các khoản phạt chậm nộp, doanh nghiệp hoàn toàn có thể chủ động khắc phục thông qua việc khai bổ sung hồ sơ thuế.

Thời hạn 10 năm để sửa sai: Bạn đã biết chưa?

Theo quy định tại khoản 1 Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019, người nộp thuế có một khoảng thời gian rất dài để điều chỉnh các sai sót:

“1. Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai, sót nhưng trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra.”

Điều này mở ra cơ hội lớn cho doanh nghiệp trong việc rà soát và tối ưu hóa nghĩa vụ thuế của mình. Tuy nhiên, điểm mấu chốt là việc khai bổ sung phải được thực hiện trước khi có quyết định thanh tra, kiểm tra chính thức từ cơ quan có thẩm quyền.

Quy trình khai bổ sung "chuẩn chỉnh" theo Nghị định 126

Việc khai bổ sung không chỉ đơn thuần là nộp lại tờ khai mới. Tùy vào mức độ ảnh hưởng đến nghĩa vụ thuế mà hồ sơ sẽ có sự khác biệt. Cụ thể, tại khoản 4 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP quy định rõ:

• Trường hợp không làm thay đổi nghĩa vụ thuế: Doanh nghiệp chỉ cần nộp Bản giải trình khai bổ sung và các tài liệu liên quan, không nhất thiết phải nộp Tờ khai bổ sung.
• Trường hợp làm tăng số thuế phải nộp: Doanh nghiệp phải nộp đủ số tiền thuế tăng thêm cùng với tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước.
• Trường hợp thay đổi số thuế GTGT còn được khấu trừ: Nếu chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau thì phải kê khai vào kỳ tính thuế hiện tại.

Nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT khi có sai sót

Một trong những vấn đề khiến kế toán lúng túng nhất là việc xử lý các hóa đơn đầu vào bị bỏ sót. Theo hướng dẫn tại khoản 8 Điều 14 Thông tư 219/2013/TT-BTC:

“Thuế GTGT đầu vào phát sinh trong kỳ nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của kỳ đó... Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai sót thì được kê khai, khấu trừ bổ sung trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.”

Như vậy, quyền lợi của doanh nghiệp luôn được bảo đảm nếu phát hiện và điều chỉnh kịp thời. Việc bỏ sót hóa đơn đầu vào không đồng nghĩa với việc mất đi số thuế được khấu trừ, miễn là doanh nghiệp tuân thủ đúng quy trình khai bổ sung.

Xử lý số thuế nộp thừa - Quyền lợi không nên bỏ qua

Sau khi khai bổ sung, nếu phát sinh số thuế GTGT nộp thừa, doanh nghiệp có quyền thực hiện các thủ tục để bù trừ hoặc hoàn thuế. Quy trình này được thực hiện theo quy định tại Điều 60 Luật Quản lý thuế 2019 và hướng dẫn chi tiết tại Điều 25 Thông tư 80/2021/TT-BTC.

Lời khuyên từ chuyên gia: Để tránh những rắc rối không đáng có, doanh nghiệp nên thiết lập quy trình kiểm soát hóa đơn chặt chẽ hàng tháng. Khi phát hiện sai sót, hãy thực hiện khai bổ sung ngay lập tức để giảm thiểu tiền chậm nộp và tối ưu dòng tiền cho đơn vị.