Đối với các doanh nghiệp có quy mô lớn, việc quản lý và phân bổ thuế thu nhập cá nhân (TNCN) cho người lao động làm việc tại nhiều chi nhánh, địa phương khác nhau luôn là một bài toán phức tạp. Một trong những thắc mắc phổ biến nhất của bộ phận kế toán là: Liệu sau khi thực hiện quyết toán thuế TNCN năm, doanh nghiệp có phải xác định lại số thuế đã phân bổ cho các tỉnh thành hay không?

Quy định về khai bổ sung và phân bổ thuế TNCN

Theo quy định tại khoản 1 Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019 (đã được sửa đổi, bổ sung tại Luật số 56/2024/QH15), người nộp thuế có quyền khai bổ sung hồ sơ khai thuế nếu phát hiện có sai sót trong thời hạn 10 năm, với điều kiện không thuộc phạm vi thanh tra, kiểm tra thuế.

Đặc biệt, điểm a khoản 4 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP nhấn mạnh rằng khi khai bổ sung hồ sơ quyết toán thuế TNCN năm, doanh nghiệp đồng thời phải khai bổ sung các tờ khai tháng hoặc quý tương ứng nếu có sai sót phát sinh.

Nguyên tắc phân bổ thuế TNCN theo địa phương

Việc phân bổ nguồn thu thuế TNCN giữa các tỉnh thành nơi người lao động làm việc được thực hiện theo hướng dẫn tại Thông tư 80/2021/TT-BTC. Cụ thể:

• Tại khoản 2 Điều 19 Thông tư 80/2021/TT-BTC, số thuế TNCN được phân bổ căn cứ vào số thuế thực tế đã khấu trừ của từng cá nhân làm việc tại tỉnh đó.
• Tại khoản 3 Điều 19 Thông tư 80/2021/TT-BTC quy định rõ: Số thuế TNCN được xác định theo tháng hoặc quý tương ứng với kỳ khai thuế và không xác định lại khi quyết toán thuế TNCN.

Hướng dẫn từ Công văn 6043/CT-CS

Dựa trên các căn cứ pháp lý nêu trên, Cục Thuế đã ban hành Công văn 6043/CT-CS để giải đáp vướng mắc liên quan đến việc xác định lại số thuế TNCN đã phân bổ. Nội dung trọng tâm khẳng định:

Số thuế TNCN đã phân bổ cho từng tỉnh theo kỳ khai thuế tháng hoặc quý sẽ không được xác định lại khi thực hiện quyết toán thuế TNCN năm.

Điều này có nghĩa là, dù kết quả quyết toán năm có thể làm thay đổi tổng số thuế phải nộp của cá nhân, thì tỷ lệ và số thuế đã "chốt" phân bổ cho các địa phương trong các kỳ khai thuế định kỳ (tháng/quý) vẫn được giữ nguyên. Hệ thống quản lý thuế tập trung (TMS) hiện nay đã được thiết lập để đáp ứng đầy đủ các yêu cầu nghiệp vụ này, giúp doanh nghiệp giảm bớt gánh nặng tính toán lại phức tạp sau quyết toán.

Lời khuyên cho doanh nghiệp và kế toán

Doanh nghiệp cần lưu ý rà soát kỹ dữ liệu khấu trừ thuế ngay từ các kỳ khai thuế tháng hoặc quý để đảm bảo tính chính xác của nguồn thu phân bổ cho các địa phương. Việc khai bổ sung chỉ nên thực hiện khi phát hiện sai sót thực tế về số thuế đã khấu trừ hoặc thông tin người lao động, và phải tuân thủ đúng trình tự quy định tại Luật Quản lý thuế 2019.