Khai và nộp lệ phí môn bài là một trong những nghĩa vụ thuế đầu tiên và quan trọng nhất mà doanh nghiệp phải thực hiện sau khi thành lập. Đối với loại hình công ty cổ phần, quy trình này đòi hỏi sự chính xác về thời hạn và mức nộp dựa trên vốn điều lệ. Bài viết dưới đây sẽ cung cấp hướng dẫn chi tiết, cập nhật các quy định mới nhất từ Nghị định 126/2020/NĐ-CP và Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

1. Lệ phí môn bài là gì?

Lệ phí môn bài (trước đây thường gọi là thuế môn bài) là khoản thu mà tổ chức, cá nhân sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ phải nộp định kỳ hàng năm vào ngân sách nhà nước. Theo quy định tại Nghị định 139/2016/NĐ-CP, mức thu này được xác định dựa trên vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư ghi trong giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh hoặc doanh thu hàng năm đối với hộ kinh doanh.

2. Mức thu lệ phí môn bài đối với công ty cổ phần

Căn cứ vào Điều 4 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, mức thu lệ phí môn bài đối với tổ chức sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ được chia thành các bậc như sau:

• Bậc 1: 3.000.000 đồng/năm đối với tổ chức có vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư trên 10 tỷ đồng.
• Bậc 2: 2.000.000 đồng/năm đối với tổ chức có vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư từ 10 tỷ đồng trở xuống.
• Bậc 3: 1.000.000 đồng/năm đối với chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh, đơn vị sự nghiệp, tổ chức kinh tế khác.

Lưu ý: Nếu công ty cổ phần có thay đổi vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư, căn cứ để xác định mức thu lệ phí môn bài là vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư của năm trước liền kề năm tính lệ phí môn bài.

3. Các trường hợp được miễn lệ phí môn bài

Một điểm mới đáng chú ý được bổ sung bởi Nghị định 22/2020/NĐ-CP là quy định về việc miễn lệ phí môn bài trong năm đầu thành lập. Cụ thể:

• Miễn lệ phí môn bài trong năm đầu thành lập hoặc ra hoạt động sản xuất, kinh doanh (từ ngày 01 tháng 01 đến ngày 31 tháng 12) đối với tổ chức thành lập mới.
• Doanh nghiệp nhỏ và vừa chuyển đổi từ hộ kinh doanh được miễn lệ phí môn bài trong thời hạn 03 năm kể từ ngày được cấp giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu.

4. Quy trình khai và nộp lệ phí môn bài

Quy trình thực hiện đối với công ty cổ phần bao gồm các bước cơ bản sau:

Bước 1: Khai lệ phí môn bài

Người nộp lệ phí mới thành lập hoặc mới ra hoạt động sản xuất, kinh doanh thực hiện khai lệ phí môn bài và nộp tờ khai cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp. Theo khoản 1 Điều 10 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, thời hạn nộp hồ sơ khai lệ phí môn bài chậm nhất là ngày 30 tháng 01 năm sau năm thành lập hoặc bắt đầu hoạt động.

Bước 2: Nộp tiền lệ phí môn bài

Sau khi nộp tờ khai, doanh nghiệp tiến hành nộp tiền vào ngân sách nhà nước thông qua các hình thức: nộp trực tiếp tại ngân hàng, kho bạc hoặc nộp điện tử qua cổng thông tin của Tổng cục Thuế.

5. Thời hạn nộp tờ khai và tiền lệ phí môn bài

Căn cứ khoản 9 Điều 18 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, thời hạn nộp lệ phí môn bài chậm nhất là ngày 30 tháng 01 hàng năm. Đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa chuyển đổi từ hộ kinh doanh, thời hạn nộp lệ phí môn bài khi hết thời gian được miễn được quy định cụ thể tùy thuộc vào thời điểm kết thúc thời gian miễn (6 tháng đầu năm hoặc 6 tháng cuối năm).

6. Mức xử phạt vi phạm về lệ phí môn bài

Việc chậm nộp tờ khai hoặc chậm nộp tiền lệ phí môn bài sẽ bị xử phạt theo quy định tại Nghị định 125/2020/NĐ-CP. Cụ thể:

Phạt cảnh cáo đối với hành vi nộp hồ sơ khai thuế quá thời hạn từ 01 ngày đến 05 ngày và có tình tiết giảm nhẹ. Mức phạt tiền có thể lên đến 25.000.000 đồng đối với hành vi nộp hồ sơ khai thuế quá thời hạn trên 90 ngày kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế.

Ngoài ra, đối với việc chậm nộp tiền lệ phí, doanh nghiệp còn phải nộp tiền chậm nộp tính theo mức 0,03%/ngày trên số tiền thuế chậm nộp.

Việc nắm vững quy trình và thời hạn nộp lệ phí môn bài giúp công ty cổ phần chủ động trong kế hoạch tài chính và tránh được những rủi ro pháp lý không đáng có. Nếu có bất kỳ vướng mắc nào, doanh nghiệp nên tham khảo ý kiến của các chuyên gia pháp lý hoặc cơ quan thuế quản lý để được hướng dẫn cụ thể.