Việc kê khai và nộp lệ phí môn bài là một trong những thủ tục hành chính thuế đầu tiên mà một doanh nghiệp phải thực hiện sau khi nhận được Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp. Đối với các công ty TNHH hai thành viên trở lên, việc xác định đúng mức vốn điều lệ để áp mức lệ phí phù hợp là vô cùng quan trọng. Bài viết dưới đây sẽ hướng dẫn chi tiết quy trình này dựa trên các quy định pháp luật hiện hành tính đến cuối năm 2018, áp dụng cho kỳ tính thuế năm 2019.

1. Đối tượng phải thực hiện khai và nộp lệ phí môn bài

Theo quy định tại Điều 2 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, người nộp lệ phí môn bài là tổ chức, cá nhân hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ. Cụ thể đối với mô hình doanh nghiệp:

• Doanh nghiệp chủ quản: Công ty TNHH hai thành viên trở lên có trách nhiệm kê khai và nộp lệ phí cho chính mình tại Chi cục Thuế quản lý trực tiếp.
• Đơn vị phụ thuộc: Các chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh của công ty cũng thuộc đối tượng phải nộp lệ phí môn bài.

Nếu các đơn vị phụ thuộc ở cùng địa phương cấp tỉnh với trụ sở chính, công ty sẽ thực hiện khai và nộp thay. Trường hợp khác tỉnh, các đơn vị này phải tự thực hiện tại cơ quan thuế sở tại.

2. Mức thu lệ phí môn bài năm 2019 đối với công ty TNHH 2 thành viên

Mức thu lệ phí môn bài không cố định mà phụ thuộc vào quy mô vốn của doanh nghiệp. Căn cứ theo Điều 4 Nghị định 139/2016/NĐ-CP và hướng dẫn tại Điều 4 Thông tư 302/2016/TT-BTC, mức thu được quy định như sau:

Căn cứ xác định mức vốn

Mức thu lệ phí môn bài đối với tổ chức dựa trên vốn điều lệ ghi trong Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp. Trường hợp không có vốn điều lệ thì căn cứ vào vốn đầu tư ghi trong Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.

Mức thu cụ thể hàng năm

• Mức 1: Vốn điều lệ trên 10 tỷ đồng: 3.000.000 đồng/năm.
• Mức 2: Vốn điều lệ từ 10 tỷ đồng trở xuống: 2.000.000 đồng/năm.
• Đơn vị phụ thuộc: Chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh: 1.000.000 đồng/năm.

3. Thời hạn kê khai và nộp lệ phí môn bài

Đây là nội dung mà các kế toán doanh nghiệp cần đặc biệt lưu tâm để tránh bị xử phạt hành chính về thuế.

Thời hạn khai lệ phí (Chỉ khai một lần khi mới thành lập)

Theo Điều 5 Nghị định 139/2016/NĐ-CP:

• Nếu doanh nghiệp bắt đầu hoạt động ngay: Chậm nhất là ngày cuối cùng của tháng bắt đầu hoạt động sản xuất kinh doanh.
• Nếu doanh nghiệp mới thành lập nhưng chưa hoạt động: Trong thời hạn 30 ngày, kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp.

Thời hạn nộp tiền lệ phí

Thời hạn nộp lệ phí môn bài chậm nhất là ngày 30 tháng 01 hàng năm. Đối với doanh nghiệp mới ra hoạt động sản xuất kinh doanh hoặc mới thành lập thì thời hạn nộp lệ phí môn bài chậm nhất là ngày cuối cùng của thời hạn nộp hồ sơ khai lệ phí.

4. Những lưu ý quan trọng cho doanh nghiệp thành lập cuối năm 2018

Pháp luật có những ưu đãi về mức nộp cho các doanh nghiệp thành lập vào giai đoạn nửa cuối năm:

"Tổ chức, cá nhân, nhóm cá nhân, hộ gia đình sản xuất, kinh doanh hoặc mới thành lập, được cấp mã số thuế và mã số doanh nghiệp, mã số số định danh trong thời gian 06 tháng đầu năm thì nộp mức lệ phí môn bài cả năm; nếu thành lập, được cấp mã số thuế và mã số doanh nghiệp, mã số định danh trong thời gian 06 tháng cuối năm thì nộp 50% mức lệ phí môn bài cả năm."

Như vậy, nếu công ty TNHH 2 thành viên của bạn được cấp phép từ ngày 01/07/2018 đến 31/12/2018, bạn chỉ phải nộp 50% mức lệ phí cho năm 2018. Tuy nhiên, từ năm 2019 trở đi, doanh nghiệp sẽ nộp 100% mức lệ phí theo quy định.

5. Hồ sơ và phương thức nộp

Hồ sơ khai lệ phí môn bài là Tờ khai lệ phí môn bài theo mẫu ban hành kèm theo Nghị định 139/2016/NĐ-CP. Hiện nay, hầu hết các doanh nghiệp đều thực hiện kê khai và nộp thuế điện tử thông qua chữ ký số, giúp tiết kiệm thời gian và chi phí đi lại.

Việc tuân thủ đúng các quy định về lệ phí môn bài không chỉ giúp doanh nghiệp khẳng định tính chuyên nghiệp mà còn tránh được những rủi ro pháp lý không đáng có ngay từ những ngày đầu khởi nghiệp. Hy vọng bài viết này đã cung cấp đầy đủ thông tin cần thiết cho các chủ doanh nghiệp và kế toán trong kỳ quyết toán thuế sắp tới.