Công văn 3509/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn quan trọng về chính sách thuế đối với các khoản chi phí phát sinh liên quan đến hoạt động của doanh nghiệp, đặc biệt là các khoản chi phí cách ly phòng, chống dịch Covid-19 cho chuyên gia nước ngoài nhập cảnh vào Việt Nam làm việc. Văn bản này đưa ra các hướng dẫn cụ thể về thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) và thuế thu nhập cá nhân (TNCN) nhằm tháo gỡ vướng mắc cho các doanh nghiệp trong quá trình thực hiện nghĩa vụ thuế.

Chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp đối với chi phí cách ly

Tổng cục Thuế hướng dẫn cụ thể về điều kiện để các khoản chi phí cách ly phòng, chống dịch của chuyên gia nước ngoài được tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN:

• Các khoản chi phí cách ly tại khách sạn, chi phí đưa đón và chi phí xét nghiệm do doanh nghiệp chi trả thay cho chuyên gia nước ngoài được coi là chi phí liên quan trực tiếp đến hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp.
• Để được tính vào chi phí được trừ, các khoản chi này phải được quy định rõ ràng trong hợp đồng lao động hoặc quy chế tài chính, quy chế chi tiêu nội bộ của doanh nghiệp.
• Doanh nghiệp phải có đầy đủ hóa đơn, chứng từ hợp pháp theo quy định của pháp luật (như hóa đơn dịch vụ lưu trú, hóa đơn vận chuyển, phiếu thu tiền xét nghiệm) và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các hóa đơn có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên.

Chính sách thuế thu nhập cá nhân đối với khoản lợi ích từ chi phí cách ly

Về nghĩa vụ thuế TNCN của chuyên gia nước ngoài đối với các khoản chi phí cách ly do doanh nghiệp chi trả:

• Trường hợp doanh nghiệp ký hợp đồng lao động với chuyên gia nước ngoài, trong đó thỏa thuận doanh nghiệp chịu trách nhiệm thanh toán các khoản chi phí cách ly thì các khoản chi này được coi là khoản lợi ích bằng tiền hoặc không bằng tiền ngoài tiền lương, tiền công mà người lao động được hưởng.
• Do đó, các khoản chi phí cách ly này phải được tính vào thu nhập chịu thuế TNCN từ tiền lương, tiền công của chuyên gia nước ngoài theo quy định của Luật Thuế thu nhập cá nhân.
• Doanh nghiệp có trách nhiệm khấu trừ, kê khai và nộp thuế TNCN thay cho chuyên gia đối với phần thu nhập chịu thuế phát sinh từ các khoản chi phí này.

Ý nghĩa pháp lý và lưu ý đối với doanh nghiệp khi áp dụng

Công văn 3509/TCT-CS mang lại sự rõ ràng trong việc hạch toán kế toán và kê khai thuế cho doanh nghiệp, tuy nhiên doanh nghiệp cần lưu ý các điểm sau:

• Cần rà soát lại toàn bộ hệ thống hợp đồng lao động và quy chế nội bộ để đảm bảo các điều khoản về chi trả chi phí cách ly được ghi nhận một cách hợp lệ, làm cơ sở pháp lý vững chắc cho việc giải trình chi phí được trừ với cơ quan thuế.
• Đảm bảo tính hợp pháp và đầy đủ của các hóa đơn, chứng từ đi kèm, tránh việc bị loại chi phí khi quyết toán thuế do thiếu chứng từ chứng minh.
• Thực hiện tính toán và khấu trừ thuế TNCN chính xác đối với phần lợi ích mà chuyên gia nước ngoài nhận được để tránh rủi ro bị xử phạt vi phạm hành chính về thuế.