Tóm tắt Công văn 3913/TCT-KK năm 2016 về khấu trừ, hoàn thuế giá trị gia tăng mặt hàng phân bón

Công văn 3913/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn giải quyết các vướng mắc liên quan đến việc khấu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với mặt hàng phân bón. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng nhằm xử lý các vấn đề chuyển tiếp khi mặt hàng phân bón chuyển từ đối tượng chịu thuế GTGT sang đối tượng không chịu thuế GTGT theo quy định tại Luật số 71/2014/QH13.

- Nguyên tắc khấu trừ, hoàn thuế GTGT đầu vào phát sinh trước ngày 01/01/2015

Công văn hướng dẫn chi tiết về việc xử lý số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết của các doanh nghiệp sản xuất, kinh doanh phân bón trước thời điểm Luật số 71/2014/QH13 có hiệu lực thi hành:

• Số thuế GTGT đầu vào phát sinh trước ngày 01/01/2015 phục vụ cho hoạt động sản xuất, kinh doanh mặt hàng phân bón (thời điểm phân bón vẫn là đối tượng chịu thuế GTGT với thuế suất 5%) nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện về khấu trừ, hoàn thuế thì được kê khai, khấu trừ và hoàn thuế theo quy định của Luật Thuế GTGT hiện hành tại thời điểm đó.
• Trường hợp người nộp thuế có số thuế GTGT đầu vào lũy kế chưa được khấu trừ hết tính đến kỳ tính thuế tháng 12/2014 hoặc quý IV/2014 thì được xem xét giải quyết hoàn thuế GTGT theo quy định về hoàn thuế đối với trường hợp có số thuế lũy kế sau 12 tháng hoặc 4 quý liên tục.

- Xử lý thuế GTGT đầu vào đối với dự án đầu tư sản xuất phân bón

Đối với các dự án đầu tư xây dựng nhà máy, dây chuyền sản xuất phân bón có sự giao thoa giữa hai thời kỳ chính sách thuế, Tổng cục Thuế đưa ra hướng dẫn cụ thể:

• Đối với số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư hình thành tài sản cố định để sản xuất phân bón phát sinh trước ngày 01/01/2015: Doanh nghiệp được kê khai, hoàn thuế GTGT theo quy định đối với dự án đầu tư nếu đáp ứng đủ điều kiện.
• Đối với số thuế GTGT đầu vào phát sinh từ ngày 01/01/2015 trở đi của dự án đầu tư sản xuất phân bón (khi phân bón đã chính thức chuyển sang đối tượng không chịu thuế GTGT): Doanh nghiệp không được kê khai, khấu trừ hoặc hoàn thuế GTGT đầu vào này. Toàn bộ số thuế GTGT đầu vào phát sinh trong giai đoạn này phải được tính vào nguyên giá tài sản cố định hoặc chi phí sản xuất kinh doanh theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp.

- Hướng dẫn kê khai điều chỉnh và thủ tục hành chính của cơ quan thuế

Để đảm bảo tính chính xác, minh bạch và tránh thất thoát ngân sách nhà nước trong quá trình chuyển đổi cơ chế thuế, Công văn yêu cầu:

• Doanh nghiệp phải thực hiện phân bổ rõ ràng, chính xác số thuế GTGT đầu vào dùng chung cho hoạt động sản xuất kinh doanh mặt hàng phân bón và các mặt hàng chịu thuế khác phát sinh trước ngày 01/01/2015 để làm cơ sở kê khai, hoàn thuế hợp pháp.
• Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu chặt chẽ hồ sơ khai thuế, hóa đơn chứng từ mua vào, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt để xác định đúng số thuế GTGT đủ điều kiện hoàn thuế.
• Các trường hợp kê khai sai, kê khai khống hoặc không phân bổ đúng tỷ lệ thuế GTGT đầu vào theo quy định sẽ bị xử lý nghiêm theo các chế tài của pháp luật về quản lý thuế.

- Ý nghĩa thực tiễn của văn bản

Công văn 3913/TCT-KK đã tháo gỡ kịp thời các nút thắt tài chính cho doanh nghiệp ngành phân bón trong giai đoạn chuyển đổi chính sách thuế lớn. Việc cho phép hoàn thuế GTGT tích lũy trước năm 2015 giúp doanh nghiệp giải phóng nguồn vốn bị ứ đọng, đồng thời tạo sự thống nhất trong việc áp dụng pháp luật thuế trên phạm vi cả nước, đảm bảo quyền lợi hợp pháp cho người nộp thuế.