Tổng quan về Công văn 1107/TCT-CS năm 2020

Công văn 1107/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp làm rõ các điều kiện, nguyên tắc bù trừ thuế và các trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư của doanh nghiệp, đảm bảo việc thực hiện thống nhất theo quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng và các văn bản hướng dẫn thi hành.

Các nội dung quy định cốt lõi của Công văn 1107/TCT-CS

- Nguyên tắc kê khai, bù trừ và hoàn thuế GTGT của dự án đầu tư

• Cơ sở kinh doanh đang hoạt động nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới (trừ dự án đầu tư xây dựng nhà để bán hoặc cho thuê mua mà không hình thành tài sản cố định) tại cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, đang trong giai đoạn đầu tư thì phải kê khai bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì cơ sở kinh doanh được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
• Trường hợp số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết dưới 300 triệu đồng thì doanh nghiệp thực hiện kết chuyển vào số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư của kỳ tiếp theo.

- Điều kiện về góp vốn điều lệ để được hoàn thuế GTGT

• Một trong những điều kiện tiên quyết để dự án đầu tư được hoàn thuế GTGT là cơ sở kinh doanh phải góp đủ số vốn điều lệ đã đăng ký theo quy định của pháp luật.
• Trường hợp cơ sở kinh doanh có dự án đầu tư nhưng chưa góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký trên Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc Điều lệ công ty thì không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư đó. Số thuế GTGT đầu vào phát sinh trong trường hợp này sẽ được chuyển khấu trừ tiếp vào các kỳ sau.

- Các trường hợp dự án đầu tư không được hoàn thuế GTGT

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện khi chưa đủ các điều kiện kinh doanh theo quy định của Luật Đầu tư (chưa được cấp giấy phép kinh doanh ngành nghề có điều kiện, giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh...).
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động sản xuất kinh doanh.
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/07/2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên theo dự án đầu tư.

- Hướng dẫn thủ tục kê khai thuế đối với dự án đầu tư

• Doanh nghiệp phải thực hiện lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư theo Mẫu số 02/GTGT.
• Số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư trên Mẫu số 02/GTGT phải được bù trừ với số thuế GTGT phải nộp trên tờ khai thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện (Mẫu số 01/GTGT) trước khi xác định số thuế đủ điều kiện đề nghị hoàn.

Đánh giá và lưu ý áp dụng thực tế

Công văn 1107/TCT-CS năm 2020 nhấn mạnh tính chặt chẽ trong việc kiểm tra điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư, đặc biệt là nghĩa vụ góp vốn điều lệ của chủ đầu tư. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát tiến độ góp vốn thực tế so với cam kết trên Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp trước khi nộp hồ sơ hoàn thuế. Việc không tuân thủ đúng tiến độ góp vốn hoặc kê khai không đúng quy trình bù trừ giữa hai tờ khai (Mẫu 01/GTGT và Mẫu 02/GTGT) có thể dẫn đến việc bị cơ quan thuế từ chối hoàn thuế và yêu cầu điều chỉnh lại số liệu kê khai.