Tổng quan về Công văn 1040/TCT-CS năm 2020

Công văn 1040/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành ngày 12 tháng 03 năm 2020 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng dành cho các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương và các doanh nghiệp về việc thực hiện chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư. Văn bản này làm rõ các điều kiện, đối tượng được hoàn thuế cũng như các trường hợp không được hoàn thuế theo đúng quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng và các văn bản hướng dẫn thi hành.

Các nội dung cốt lõi về điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

• Đối tượng được áp dụng hoàn thuế: Cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư đã đăng ký doanh nghiệp, đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, hoặc cơ sở kinh doanh đang hoạt động có dự án đầu tư mới (bao gồm cả dự án đầu tư cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính) đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh.
• Ngưỡng trị giá thuế được hoàn: Số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư lũy kế từ 300 triệu đồng trở lên thì được xét hoàn thuế GTGT.
• Nguyên tắc bù trừ thuế: Trước khi xác định số thuế GTGT được hoàn cho dự án đầu tư, cơ sở kinh doanh phải thực hiện bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện (nếu có). Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào còn lại của dự án đầu tư từ 300 triệu đồng trở lên thì mới được hoàn thuế.

Các trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Tổng cục Thuế nhấn mạnh các trường hợp không được hoàn thuế GTGT nhằm đảm bảo tính minh bạch và tuân thủ pháp luật của doanh nghiệp:

• Chưa góp đủ vốn điều lệ: Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế GTGT nếu cơ sở kinh doanh đó chưa góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật về doanh nghiệp.
• Vi phạm điều kiện kinh doanh: Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa được cấp giấy phép kinh doanh ngành, nghề có điều kiện; chưa được cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh; hoặc chưa có văn bản chấp thuận, cho phép của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
• Dự án khai thác tài nguyên, khoáng sản: Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/7/2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên tính theo dự án đầu tư.

Hướng dẫn kê khai và thủ tục hoàn thuế

• Mẫu tờ khai áp dụng: Người nộp thuế phải lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư theo Mẫu số 02/GTGT ban hành kèm theo các thông tư hướng dẫn của Bộ Tài chính.
• Trách nhiệm kiểm tra của cơ quan thuế: Cơ quan thuế địa phương có trách nhiệm rà soát, đối chiếu chặt chẽ hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp. Việc kiểm tra tập trung vào tính hợp pháp của hóa đơn, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, tiến độ góp vốn điều lệ thực tế, và việc đáp ứng các điều kiện về giấy phép đối với ngành nghề kinh doanh có điều kiện trước khi ban hành quyết định hoàn thuế.