Trả lời công văn số 1002/HHVN-KT ngày 30/06/2009 của Tổng công ty Hàng hải Việt Nam về việc xử phạt thuế, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Căn cứ quy định tại Điều 107 Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 ngày 29/11/2006: "Người nộp thuế đã phản ánh đầy đủ, trung thực các nghiệp vụ kinh tế làm phát sinh nghĩa vụ thuế trên sổ sách kế toán, hoá đơn, chứng từ nhưng khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp hoặc tăng số tiền thuế được hoàn hoặc khai sai nhưng không thuộc trường hợp quy định tại khoản 6 và khoản 7 Điều 108 của Luật này dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp hoặc tăng số tiền thuế được hoàn thì phải nộp đủ số tiền thuế khai thiếu, nộp lại số tiền thuế được hoàn cao hơn và bị xử phạt 10% số tiền thuế khai thiếu, số tiền thuế được hoàn cao hơn và phạt tiền thuế chậm nộp trên số tiền thuế thiếu hoặc số tiền thuế được hoàn cao hơn".

Căn cứ Điều 8; Khoản 1 và Khoản 2 Điều 13 Nghị định số 98/2007/NĐ-CP ngày 07/6/2007 của Chính phủ quy định về xử lý vi phạm pháp luật về thuế và cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế;

Trường hợp Cục Thuế khi thực hiện kiểm tra trước hoàn thuế tại Tổng công ty Hàng hải có phát sinh chênh lệch số tiền thuế đề nghị hoàn cao hơn số kiểm tra được hoàn do đơn vị kê khai chứng từ nộp khâu nhập khẩu đã quá thời hạn 3 tháng và kê khai thiếu doanh thu; nếu kiểm tra, loại trừ các hoá đơn kê khai không đúng quy định nhưng không làm ảnh hưởng đến số tiền thuế phải nộp, Cục Thuế xác định hoàn trên số thuế đã loại trừ thì đơn vị không bị xử phạt về hành vi khai sai theo Điều 13 Nghị định số 98/2007/NĐ-CP, đơn vị bị xử phạt về hành vi vi phạm về thủ tục thuế theo quy định tại Điều 8 Nghị định số 98/2007/NĐ-CP nêu trên.

Tổng cục Thuế trả lời để Tổng công ty Hàng hải và Cục Thuế thành phố Hà Nội được biết. Đề nghị Công ty liên hệ với Cục Thuế thành phố Hà Nội để được hướng dẫn giải quyết theo quy định./.