Công văn 3402/TCT-KK năm 2017 do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư. Văn bản này đưa ra các hướng dẫn cụ thể dựa trên các quy định pháp luật thuế hiện hành, giúp doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương thực hiện thống nhất các điều kiện và thủ tục hoàn thuế.

Cơ sở pháp lý áp dụng trong công tác hoàn thuế GTGT

Công văn 3402/TCT-KK được xây dựng dựa trên việc áp dụng đồng bộ các văn bản quy phạm pháp luật về thuế GTGT tại thời điểm ban hành, bao gồm:

• Luật số 106/2016/QH13 sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật Quản lý thuế.
• Nghị định số 100/2016/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế GTGT.
• Thông tư số 130/2016/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn chi tiết về hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư.

Điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới

Theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế, cơ sở kinh doanh được xét hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới khi đáp ứng đầy đủ các điều kiện sau:

• Cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới (bao gồm cả dự án đầu tư mới cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính) đang trong giai đoạn đầu tư.
• Số thuế GTGT đầu vào lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tư sau khi bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện (nếu có) đạt từ 300 triệu đồng trở lên.
• Dự án đầu tư phải được thực hiện theo đúng quy định của pháp luật về đầu tư, có đầy đủ hồ sơ pháp lý như Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, quyết định chủ trương đầu tư (nếu có).

Các trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Công văn 3402/TCT-KK lưu ý cơ quan thuế và doanh nghiệp về các trường hợp không được hoàn thuế GTGT mà phải chuyển kỳ sau, bao gồm:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật. Việc kiểm tra tiến độ góp vốn điều lệ là điều kiện bắt buộc trước khi giải quyết hoàn thuế.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa đáp ứng đủ điều kiện kinh doanh theo quy định của Luật Đầu tư (chưa được cấp giấy phép, giấy chứng nhận đủ điều kiện hoặc chưa có văn bản chấp thuận của cơ quan có thẩm quyền).
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/07/2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên.

Hướng dẫn về thủ tục kê khai và bù trừ thuế GTGT

Để thực hiện hoàn thuế đúng quy định, doanh nghiệp cần tuân thủ quy trình kê khai và bù trừ thuế như sau:

• Doanh nghiệp phải kê khai riêng thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư trên Tờ khai thuế GTGT dành cho dự án đầu tư (Mẫu số 02/GTGT).
• Trước khi xác định số thuế đề nghị hoàn, doanh nghiệp phải thực hiện bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Chỉ sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào còn lại của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì doanh nghiệp mới được lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.