Ngày 26/04/2013 Tổng cục Thuế có văn bản số 1361/TCT-CS trả lời văn bản số 7195/CT-TTHT ngày 20/09/2012 của Cục Thuế về việc trích khấu hao khi xác định thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) đối với tài sản cố định (TSCĐ) xây dựng trên đất thuê, đất mượn của các tổ chức, cá nhân, hộ gia đình (không trực tiếp thuê đất của nhà nước hoặc thuê đất trong khu công nghiệp). Để việc thực hiện được thống nhất, Cục Thuế TP hướng dẫn như sau:

Căn cứ Thông tư số 123/2012/TT-BTC ngày 27/07/2012 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế TNDN:

+ Tại Tiết g, Khoản 2.2, Điều 6 quy định về trích khấu hao TSCĐ:

“...

Trường hợp công trình trên đất như trụ sở văn phòng, nhà xưởng, cửa hàng kinh doanh phục vụ cho hoạt động sản xuất kinh doanh được xây dựng trên đất thuê, đất mượn của các tổ chức, cá nhân, hộ gia đình (không trực tiếp thuê đất của nhà nước hoặc thuê đất trong khu công nghiệp) doanh nghiệp chỉ được trích khấu hao tính vào chi phí được trừ theo đúng mức trích khấu hao tài sản cố định quy định hiện hành của Bộ Tài chính đối với các công trình này nếu đáp ứng các điều kiện sau:

- Có hợp đồng thuê đất, mượn đất giữa doanh nghiệp với đơn vị có đất và đại diện doanh nghiệp phải chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của hợp đồng.

- Hóa đơn thanh toán khối lượng công trình xây dựng bàn giao kèm theo hợp đồng xây dựng công trình, thanh lý hợp đồng, quyết toán giá trị công trình xây dựng mang tên, địa chỉ và mã số thuế của doanh nghiệp .

- Công trình trên đất được quản lý, theo dõi hạch toán theo quy định hiện hành về quản lý tài sản cố định”.

+ Tại Khoản 1, Khoản 11, Điều 23 quy định về hiệu lực thi hành:

“...

1. Thông tư này có hiệu lực từ ngày 10 tháng 9 năm 2012 và áp dụng cho kỳ tính thuế thu nhập doanh nghiệp từ năm 2012 trở đi.

...

11. Việc giải quyết những tồn tại về thuế, quyết toán thuế, miễn thuế, giảm thuế và xử lý vi phạm pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp trước kỳ tính thuế năm 2012 thực hiện theo các quy định tương ứng hướng dẫn về thuế thu nhập doanh nghiệp ban hành trước kỳ tính thuế năm 2012”.

Trường hợp doanh nghiệp xây dựng công trình (văn phòng, nhà xưởng, cửa hàng kinh doanh) trên đất thuê, đất mượn của các tổ chức, cá nhân, hộ gia đình (không trực tiếp thuê đất của nhà nước hoặc thuê đất trong khu công nghiệp) để phục vụ cho hoạt động sản xuất, kinh doanh mà hợp đồng thuê đất, mượn đất được ký trước ngày Thông tư số 123/2012/TT-BTC có hiệu lực thi hành (ngày 10/09/2012) nhưng vẫn thuộc kỳ tính thuế năm 2012, đáp ứng các điều kiện quy định tại Tiết g, Khoản 2.2, Điều 6 Thông tư số 123/2012/TT-BTC thì doanh nghiệp được trích khấu hao đối với công trình trên đất thuê, đất mượn tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN.

Trường hợp doanh nghiệp ký hợp thuê đất, mượn đất của các tổ chức, cá nhân, hộ gia đình để phục vụ cho hoạt động sản xuất, kinh doanh mà hợp đồng thuê đất, mượn đất được ký trước ngày 01/01/2012 thì các điều kiện, thủ tục áp dụng để trích khấu hao tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN vẫn được thực hiện theo quy định tại Khoản 2.2.h, Mục IV, Phần C Thông tư số 130/2008/TT-BTC ngày 26/12/2008 của Bộ Tài chính.

Cục Thuế TP thông báo các Phòng thuộc Cục, các Chi cục thuế quận, huyện để biết và thực hiện.