Công văn 786/TXNK-CST năm 2017 do Cục Thuế xuất nhập khẩu ban hành là văn bản hướng dẫn quan trọng về việc tính thuế đối với nguyên liệu, vật tư nhập khẩu dùng để sản xuất hàng hóa xuất khẩu. Văn bản này giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và các văn bản hướng dẫn thi hành liên quan đến loại hình sản xuất xuất khẩu (SXXK).

- Phạm vi và đối tượng áp dụng chính sách thuế

• Áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân nhập khẩu nguyên liệu, vật tư để trực tiếp sản xuất hoặc thuê gia công, sản xuất hàng hóa xuất khẩu.
• Xác định rõ nghĩa vụ thuế đối với lượng nguyên liệu, vật tư tiêu hao, dư thừa, phế liệu, phế phẩm thu được trong quá trình sản xuất sản phẩm xuất khẩu.
• Hướng dẫn xử lý thuế trong các trường hợp thay đổi mục đích sử dụng, chuyển tiêu thụ nội địa đối với nguyên liệu nhập khẩu ban đầu thuộc đối tượng miễn thuế.

- Nguyên tắc tính thuế và miễn thuế đối với nguyên liệu nhập khẩu

• Nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu được miễn thuế nhập khẩu nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện về cơ sở sản xuất, quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng máy móc, thiết bị tại cơ sở sản xuất và thực tế có hoạt động sản xuất.
• Doanh nghiệp phải thực hiện báo cáo quyết toán tình hình sử dụng nguyên liệu, vật tư nhập khẩu với cơ quan hải quan theo năm tài chính để chứng minh lượng nguyên liệu đã được đưa vào sản xuất sản phẩm thực tế xuất khẩu.
• Trường hợp nguyên liệu, vật tư nhập khẩu không được đưa vào sản xuất hoặc sản phẩm sản xuất ra không được xuất khẩu thì doanh nghiệp phải kê khai, nộp đủ thuế nhập khẩu và các loại thuế liên quan khác theo quy định.

- Quy định xử lý thuế đối với phế liệu, phế phẩm và nguyên liệu dư thừa

• Đối với phế liệu, phế phẩm thu được trong quá trình sản xuất hàng xuất khẩu khi bán, thanh lý ra thị trường nội địa: Doanh nghiệp được miễn thuế nhập khẩu nhưng phải kê khai, nộp thuế giá trị gia tăng, thuế tiêu thụ đặc biệt hoặc thuế bảo vệ môi trường (nếu có) theo quy định của pháp luật thuế nội địa.
• Đối với nguyên liệu, vật tư dư thừa sau khi kết thúc chu kỳ sản xuất hoặc không còn nhu cầu sử dụng cho mục đích xuất khẩu: Khi chuyển tiêu thụ nội địa, doanh nghiệp phải đăng ký tờ khai hải quan mới, kê khai và nộp đủ thuế nhập khẩu, thuế giá trị gia tăng theo trị giá tính thuế và thuế suất tại thời điểm chuyển đổi mục đích sử dụng.

- Trách nhiệm của doanh nghiệp và cơ quan hải quan

• Doanh nghiệp có trách nhiệm quản lý, lưu trữ đầy đủ chứng từ, sổ sách kế toán, hồ sơ kỹ thuật liên quan đến định mức sử dụng nguyên liệu và quá trình sản xuất để phục vụ công tác kiểm tra, thanh tra của cơ quan hải quan.
• Cơ quan hải quan thực hiện công tác kiểm tra sau thông quan, đối chiếu số liệu báo cáo quyết toán của doanh nghiệp nhằm đảm bảo tính chính xác, trung thực của lượng nguyên liệu được miễn thuế và xử lý nghiêm các hành vi gian lận thuế.