Giới thiệu về Công văn 5338/TCT-KK năm 2016

Công văn 5338/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành ngày 25/11/2016 hướng dẫn về việc kê khai, khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các hóa đơn đầu vào bị bỏ sót. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp doanh nghiệp tháo gỡ vướng mắc trong quá trình kê khai bổ sung thuế GTGT, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế khi phát hiện sai sót trong quá trình quản lý hóa đơn.

Quy định về thời hạn kê khai, khấu trừ hóa đơn GTGT đầu vào bỏ sót

Căn cứ theo các quy định pháp luật về thuế GTGT hiện hành (đặc biệt là Thông tư số 219/2013/TT-BTC và các văn bản sửa đổi, bổ sung), Tổng cục Thuế hướng dẫn nguyên tắc kê khai hóa đơn bỏ sót như sau:

• Thời điểm phát hiện hóa đơn bỏ sót: Trường hợp người nộp thuế phát hiện hóa đơn GTGT đầu vào của các kỳ trước bị bỏ sót chưa kê khai, khấu trừ thì được thực hiện kê khai, khấu trừ bổ sung.
• Thời hạn thực hiện: Việc kê khai, khấu trừ bổ sung hóa đơn đầu vào bỏ sót được thực hiện vào kỳ tính thuế phát hiện hóa đơn bỏ sót.
• Điều kiện về thời gian: Việc kê khai bổ sung này phải được thực hiện trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra thuế, kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.

Hướng dẫn xử lý cụ thể theo từng trường hợp

Công văn 5338/TCT-KK làm rõ cách thức xử lý đối với các trường hợp cụ thể nhằm thống nhất thực hiện trong toàn ngành thuế:

• Trường hợp phát hiện trước khi có quyết định thanh tra, kiểm tra: Người nộp thuế phát hiện hóa đơn bỏ sót của kỳ nào thì kê khai, khấu trừ bổ sung vào kỳ tính thuế phát hiện hóa đơn bỏ sót đó. Doanh nghiệp không phải lập hồ sơ khai bổ sung của kỳ phát sinh hóa đơn mà kê khai trực tiếp vào các chỉ tiêu liên quan đến mua vào trên Tờ khai thuế GTGT của kỳ phát hiện hiện tại.
• Trường hợp phát hiện sau khi đã có quyết định thanh tra, kiểm tra: Nếu cơ quan thuế đã công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế, doanh nghiệp không được tự ý kê khai, khấu trừ bổ sung đối với các hóa đơn đầu vào phát sinh trước thời kỳ thanh tra, kiểm tra mà bị bỏ sót. Việc xử lý các hóa đơn này sẽ thực hiện theo kết luận và quyết định xử lý của đoàn thanh tra, kiểm tra.

Ý nghĩa và lưu ý đối với doanh nghiệp

Hướng dẫn tại Công văn 5338/TCT-KK mang lại sự chủ động cho doanh nghiệp trong việc tự rà soát và khắc phục sai sót, đồng thời đặt ra yêu cầu nghiêm ngặt về tính kịp thời:

• Tối ưu hóa quyền lợi thuế: Doanh nghiệp được bảo vệ quyền khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với các hóa đơn bị bỏ sót mà không bị giới hạn khắt khe về thời gian 6 tháng như quy định cũ trước đây, miễn là việc kê khai được thực hiện trước khi có quyết định thanh tra, kiểm tra.
• Tăng cường công tác kiểm soát nội bộ: Doanh nghiệp cần chủ động rà soát, đối chiếu hóa đơn chứng từ định kỳ để phát hiện sớm các hóa đơn bị bỏ sót, tránh việc bị mất quyền khấu trừ khi cơ quan thuế đã công bố quyết định thanh tra, kiểm tra tại doanh nghiệp.
• Tính hợp pháp của hóa đơn: Các hóa đơn bỏ sót khi đưa vào kê khai bổ sung vẫn phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào theo quy định pháp luật hiện hành (như có hóa đơn GTGT hợp pháp, có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hóa đơn từ 20 triệu đồng trở lên).