Công văn 1225/TCT-KK được Tổng cục Thuế ban hành năm 2024 nhằm chỉ đạo, hướng dẫn các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương tăng cường công tác quản lý, đẩy nhanh tiến độ giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) nhưng vẫn đảm bảo kiểm soát chặt chẽ, phòng chống gian lận thuế hiệu quả.

- Phân loại và xử lý hồ sơ hoàn thuế GTGT

Tổng cục Thuế yêu cầu các Cục Thuế thực hiện phân loại hồ sơ hoàn thuế GTGT nghiêm túc và chính xác theo quy định của Luật Quản lý thuế và Thông tư số 80/2021/TT-BTC:

• Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau: Phải được giải quyết nhanh chóng trong thời hạn quy định nếu đáp ứng đầy đủ điều kiện. Cơ quan thuế không được tự ý kéo dài thời gian giải quyết hoặc chuyển sang diện kiểm tra trước khi chưa có đủ căn cứ pháp lý.
• Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau: Áp dụng đối với các trường hợp có rủi ro cao về thuế, doanh nghiệp có dấu hiệu vi phạm pháp luật hoặc theo quy định bắt buộc của Luật Quản lý thuế. Quá trình kiểm tra phải tập trung vào các nội dung trọng tâm, tránh gây phiền hà cho doanh nghiệp hoạt động lành mạnh.

- Nguyên tắc giải quyết hoàn thuế khi chưa có kết quả xác minh hóa đơn

Để tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp trong việc chờ đợi kết quả xác minh từ các cơ quan liên quan, Công văn 1225/TCT-KK đưa ra hướng dẫn cụ thể:

• Đối với các hóa đơn, chứng từ đang trong quá trình xác minh (chưa có kết quả từ cơ quan công an hoặc cơ quan thuế địa phương khác), nếu phần giá trị thuế GTGT còn lại của hồ sơ vẫn đủ điều kiện hoàn thuế thì cơ quan thuế tiến hành giải quyết hoàn thuế trước cho phần đủ điều kiện đó.
• Phần thuế GTGT liên quan đến các hóa đơn chưa có kết quả xác minh sẽ được giữ lại để tiếp tục xử lý sau khi có kết quả chính thức.
• Trường hợp kết quả xác minh xác định hóa đơn không hợp pháp hoặc có hành vi gian lận, cơ quan thuế sẽ xử lý nghiêm theo quy định pháp luật, thậm chí chuyển hồ sơ sang cơ quan điều tra nếu có dấu hiệu tội phạm hình sự.

- Tăng cường trách nhiệm của cơ quan thuế và công chức thuế

Văn bản nhấn mạnh vai trò và trách nhiệm của người đứng đầu cũng như công chức trực tiếp thụ lý hồ sơ hoàn thuế:

• Thủ trưởng các Cục Thuế phải trực tiếp chỉ đạo, chịu trách nhiệm toàn diện về công tác hoàn thuế GTGT tại địa phương, đảm bảo giải quyết hồ sơ đúng hạn, đúng quy trình quy định.
• Nghiêm cấm các hành vi gây khó khăn, nhũng nhiễu, tự ý kéo dài thời gian giải quyết hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp một cách vô lý.
• Công chức thuế phải nâng cao tinh thần trách nhiệm, thực hiện đúng chức trách nhiệm vụ, không né tránh, đùn đẩy trách nhiệm trong việc thẩm định và quyết định hoàn thuế.

- Phối hợp liên ngành và ứng dụng công nghệ thông tin

Để nâng cao hiệu quả quản lý thuế và rút ngắn thời gian xử lý hồ sơ, Tổng cục Thuế chỉ đạo:

• Tăng cường phối hợp chặt chẽ giữa các cơ quan thuế địa phương trong việc xác minh nguồn gốc hàng hóa, hóa đơn mua vào bán ra của doanh nghiệp.
• Đẩy mạnh ứng dụng công nghệ thông tin, sử dụng hệ thống cơ sở dữ liệu hóa đơn điện tử để phân tích rủi ro, phát hiện nhanh các doanh nghiệp có dấu hiệu mua bán hóa đơn bất hợp pháp nhằm ngăn chặn kịp thời hành vi trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.