Công văn 1119/TCT-CS được Tổng cục Thuế ban hành năm 2017 nhằm giải quyết các vướng mắc và hướng dẫn chi tiết về phương pháp tính thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các doanh nghiệp, cơ sở kinh doanh. Nội dung văn bản tập trung vào việc xác định điều kiện áp dụng phương pháp khấu trừ thuế, thủ tục đăng ký tự nguyện và nguyên tắc áp dụng nhất quán phương pháp tính thuế.

- Xác định phương pháp tính thuế GTGT đối với doanh nghiệp mới thành lập

• Doanh nghiệp mới thành lập từ dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh đang hoạt động nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, hoặc doanh nghiệp mới thành lập có thực hiện dự án đầu tư, được phép đăng ký tự nguyện áp dụng phương pháp khấu trừ thuế nếu đáp ứng đủ các điều kiện về cơ sở vật chất, hóa đơn chứng từ theo quy định.
• Cơ sở kinh doanh mới thành lập phải chủ động xác định phương thức hoạt động, quy mô vốn và các điều kiện đi kèm để thực hiện đăng ký phương pháp tính thuế phù hợp với quy định của pháp luật thuế GTGT hiện hành.

- Quy định về việc nộp Mẫu 06/GTGT để đăng ký phương pháp khấu trừ

• Để được áp dụng phương pháp khấu trừ thuế GTGT, các doanh nghiệp mới thành lập hoặc doanh nghiệp có doanh thu hàng năm dưới ngưỡng 1 tỷ đồng phải thực hiện gửi Mẫu 06/GTGT đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp để đăng ký tự nguyện.
• Thời hạn nộp Mẫu 06/GTGT phải tuân thủ nghiêm ngặt theo các hướng dẫn tại Thông tư của Bộ Tài chính. Việc chậm trễ hoặc không nộp Mẫu 06/GTGT đúng hạn sẽ dẫn đến việc doanh nghiệp phải chuyển sang áp dụng phương pháp tính thuế trực tiếp trên giá trị gia tăng.
• Tổng cục Thuế yêu cầu các cơ quan thuế địa phương tăng cường rà soát, hỗ trợ và tạo điều kiện thuận lợi cho người nộp thuế trong quá trình tiếp nhận, xử lý Mẫu 06/GTGT nhằm đảm bảo quyền lợi tối đa cho doanh nghiệp.

- Nguyên tắc áp dụng nhất quán phương pháp tính thuế GTGT

• Phương pháp tính thuế GTGT sau khi đã đăng ký và được cơ quan thuế chấp thuận phải được áp dụng ổn định trong chu kỳ hai năm liên tục. Doanh nghiệp không được tự ý thay đổi phương pháp tính thuế giữa chừng trong năm tài chính.
• Đối với các chi nhánh, đơn vị trực thuộc của doanh nghiệp, phương pháp tính thuế GTGT phải được áp dụng thống nhất với phương pháp tính thuế của trụ sở chính để đảm bảo tính đồng bộ, tránh xung đột trong công tác quản lý hóa đơn và kê khai thuế.