Công văn số 509/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về các quy định và điều kiện áp dụng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) đối với các dự án đầu tư của doanh nghiệp, nhằm tháo gỡ các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực thi chính sách thuế.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các doanh nghiệp có hoạt động đầu tư, sản xuất kinh doanh thuộc diện được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định của pháp luật, đồng thời là căn cứ hướng dẫn cho các cơ quan thuế địa phương trong quá trình quản lý, thanh tra và kiểm tra thuế.

Nguyên tắc áp dụng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

• Doanh nghiệp phải thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật và nộp thuế theo phương pháp kê khai để làm cơ sở hưởng các mức ưu đãi thuế TNDN.
• Ưu đãi thuế TNDN chỉ được áp dụng đối với các khoản thu nhập phát sinh từ hoạt động sản xuất kinh doanh đáp ứng đầy đủ các điều kiện ưu đãi về địa bàn, lĩnh vực hoặc quy mô đầu tư đã được đăng ký và phê duyệt.
• Trong cùng một kỳ tính thuế, nếu doanh nghiệp có phát sinh nhiều khoản thu nhập được hưởng các mức ưu đãi thuế khác nhau thì phải chủ động hạch toán riêng biệt từng khoản thu nhập để áp dụng mức ưu đãi tương ứng.

Điều kiện xác định ưu đãi đối với dự án đầu tư mới

• Dự án đầu tư mới được hưởng ưu đãi thuế phải là dự án thực hiện lần đầu hoặc dự án hoạt động độc lập với các dự án đầu tư hiện hữu của doanh nghiệp.
• Các tiêu chí phân biệt giữa dự án đầu tư mới và dự án đầu tư mở rộng cần được xác định rõ ràng dựa trên giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, nguồn vốn thực hiện và quy trình công nghệ áp dụng.
• Thu nhập từ dự án đầu tư mới được hưởng ưu đãi thuế suất có thời hạn hoặc miễn, giảm thuế có thời hạn phải tuân thủ nghiêm ngặt các mốc thời gian bắt đầu phát sinh doanh thu và thu nhập chịu thuế.

Quy định ưu đãi đối với dự án đầu tư mở rộng

• Doanh nghiệp có dự án đầu tư đang hoạt động khi tiến hành đầu tư mở rộng quy mô sản xuất, nâng cao công suất hoặc đổi mới công nghệ nếu đáp ứng các tiêu chí quy định sẽ được lựa chọn hưởng ưu đãi thuế theo dự án đang hoạt động hoặc áp dụng theo diện dự án đầu tư mới cho phần thu nhập tăng thêm.
• Yêu cầu bắt buộc đối với doanh nghiệp là phải hạch toán riêng phần thu nhập tăng thêm từ hoạt động đầu tư mở rộng. Trường hợp không hạch toán riêng được, phần thu nhập tăng thêm được xác định theo tỷ lệ giữa nguyên giá tài sản cố định đầu tư mới đưa vào sử dụng so với tổng nguyên giá tài sản cố định của doanh nghiệp.

Thủ tục thực hiện và thẩm quyền quyết định

• Doanh nghiệp tự xác định các điều kiện ưu đãi thuế, mức thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế và số lỗ được chuyển trừ vào thu nhập chịu thuế để tự kê khai và quyết toán thuế với cơ quan thuế trực tiếp quản lý.
• Cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra, thanh tra tính chính xác, hợp pháp của việc tự xác định ưu đãi thuế của doanh nghiệp nhằm đảm bảo thực hiện đúng quy định của pháp luật thuế TNDN.

Hiệu lực thi hành

Công văn số 509/TCT-CS có hiệu lực hướng dẫn kể từ ngày ban hành, là cơ sở pháp lý quan trọng để các doanh nghiệp và cơ quan thuế thống nhất phương án xử lý các hồ sơ ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp còn vướng mắc.