Công văn số 1730/TCT-PCCS của Tổng cục Thuế là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng liên quan đến thủ tục đăng ký thời gian miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Nội dung công văn tập trung giải quyết các vướng mắc của doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương trong việc áp dụng ưu đãi thuế khi doanh nghiệp chậm trễ hoặc gặp sai sót trong khâu thực hiện thủ tục hành chính đăng ký ưu đãi.

Nguyên tắc áp dụng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN

• Doanh nghiệp được hưởng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN khi đáp ứng đầy đủ các điều kiện thực tế về địa bàn ưu đãi đầu tư, lĩnh vực khuyến khích đầu tư hoặc quy mô dự án theo quy định của pháp luật thuế tại thời điểm thành lập hoặc triển khai dự án.
• Ưu đãi thuế TNDN được áp dụng dựa trên nguyên tắc tự khai, tự tính và tự chịu trách nhiệm của người nộp thuế đối với các điều kiện ưu đãi thực tế mà doanh nghiệp đáp ứng.

Hướng dẫn xử lý trường hợp chậm hoặc không đăng ký thời gian miễn, giảm thuế

• Trường hợp doanh nghiệp thực tế đáp ứng đầy đủ các điều kiện để được hưởng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN nhưng do sơ suất không thực hiện đăng ký hoặc chậm đăng ký thời gian miễn, giảm thuế với cơ quan thuế quản lý trực tiếp, doanh nghiệp vẫn được quyền hưởng ưu đãi thuế TNDN theo đúng điều kiện thực tế đáp ứng.
• Việc chậm nộp hoặc không nộp hồ sơ đăng ký thời gian miễn, giảm thuế không làm mất đi quyền được hưởng ưu đãi thuế hợp pháp của doanh nghiệp, nhằm bảo đảm quyền lợi tối đa cho người nộp thuế theo đúng tinh thần khuyến khích đầu tư của Luật Thuế TNDN.
• Tuy nhiên, đối với hành vi chậm nộp hồ sơ, tài liệu đăng ký ưu đãi thuế so với thời hạn quy định, doanh nghiệp sẽ bị xử phạt vi phạm hành chính về hành vi vi phạm thủ tục thuế theo các quy định xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực thuế hiện hành.

Trách nhiệm của doanh nghiệp và cơ quan thuế quản lý

• Đối với doanh nghiệp: Có trách nhiệm tự xác định các điều kiện ưu đãi, mức thuế suất ưu đãi, thời hạn miễn thuế, giảm thuế và số thuế được miễn, giảm trong hồ sơ khai thuế, quyết toán thuế hàng năm. Doanh nghiệp phải lưu trữ đầy đủ hồ sơ, chứng từ chứng minh việc đáp ứng các điều kiện ưu đãi để xuất trình khi cơ quan thuế thực hiện thanh tra, kiểm tra.
• Đối với cơ quan thuế: Thực hiện tiếp nhận hồ sơ, hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện đúng thủ tục. Đồng thời, cơ quan thuế có trách nhiệm tăng cường công tác hậu kiểm, thanh tra, kiểm tra việc áp dụng ưu đãi thuế TNDN tại doanh nghiệp. Trường hợp phát hiện doanh nghiệp kê khai ưu đãi không đúng đối tượng hoặc không đủ điều kiện, cơ quan thuế sẽ thực hiện truy thu đủ số thuế trốn, gian lận và xử phạt nghiêm theo quy định của pháp luật.