Công văn 6062/TCHQ-GSQL do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm hướng dẫn giải quyết các vướng mắc liên quan đến việc xác nhận thực xuất trên hệ thống thông tin hải quan, làm cơ sở pháp lý để cơ quan thuế thực hiện hoàn thuế giá trị gia tăng (VAT) cho doanh nghiệp xuất khẩu.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản này áp dụng đối với các Cục Hải quan tỉnh, thành phố, các Chi cục Hải quan cửa khẩu trực tiếp làm thủ tục thông quan, cơ quan thuế các cấp thực hiện công tác quản lý và hoàn thuế, cùng các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực xuất khẩu hàng hóa ra nước ngoài hoặc vào khu phi thuế quan.

Nguyên tắc xác nhận thực xuất trên hệ thống điện tử

• Việc xác nhận hàng hóa thực xuất được thực hiện hoàn toàn trên Hệ thống thông tin nghiệp vụ hải quan (VNACCS/VCIS) dựa trên thông tin phản hồi từ cửa khẩu xuất.
• Cơ quan hải quan không thực hiện xác nhận bằng giấy (ký tên, đóng dấu công chức) trên tờ khai hải quan giấy đối với các trường hợp đã được hệ thống ghi nhận thông tin thực xuất, trừ các trường hợp đặc biệt theo quy định riêng của Bộ Tài chính.
• Thông tin thực xuất trên hệ thống điện tử có giá trị pháp lý tương đương với xác nhận bằng giấy và là căn cứ duy nhất để cơ quan thuế kiểm tra, đối chiếu khi giải quyết hồ sơ hoàn thuế VAT.

Cơ chế phối hợp và chia sẻ dữ liệu giữa Hải quan và Thuế

• Cơ quan thuế có trách nhiệm tra cứu thông tin về tờ khai hải quan đã thông quan và trạng thái thực xuất của lô hàng trực tiếp trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Hải quan.
• Trường hợp thông tin trên hệ thống của cơ quan thuế và cơ quan hải quan đã đồng bộ, cơ quan thuế thực hiện các bước hoàn thuế VAT theo đúng quy định mà không yêu cầu doanh nghiệp phải nộp thêm chứng từ giấy xác nhận thực xuất.
• Tăng cường trao đổi thông tin điện tử giữa hai ngành nhằm phát hiện, ngăn chặn các hành vi gian lận thương mại, chiếm đoạt tiền hoàn thuế VAT thông qua việc khai khống hồ sơ xuất khẩu.

Xử lý các trường hợp vướng mắc và lỗi hệ thống

• Đối với các lô hàng thực tế đã xuất khẩu (đã xếp lên phương tiện vận tải xuất cảnh, đã qua khu vực giám sát hải quan cửa khẩu) nhưng trên hệ thống chưa cập nhật trạng thái "đã thực xuất", Chi cục Hải quan nơi đăng ký tờ khai có trách nhiệm phối hợp với Chi cục Hải quan cửa khẩu xuất để kiểm tra, xác minh.
• Nếu xác định hàng hóa đã thực xuất, cơ quan hải quan phải tiến hành cập nhật thủ công trạng thái thực xuất trên hệ thống hoặc phát hành văn bản xác nhận gửi cho doanh nghiệp và cơ quan thuế liên quan để không làm ảnh hưởng đến tiến độ hoàn thuế của doanh nghiệp.
• Hướng dẫn chi tiết quy trình xác nhận đối với một số loại hình xuất khẩu đặc thù như xuất khẩu tại chỗ, hàng hóa đưa vào kho ngoại quan, hoặc hàng hóa xuất khẩu qua các cửa khẩu đường bộ, đường sông có quy trình giám sát thủ công.

Công văn 6062/TCHQ-GSQL có hiệu lực thi hành kể từ ngày ban hành, đóng vai trò quan trọng trong việc tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp xuất khẩu, đồng thời thúc đẩy tiến trình cải cách hành chính và hiện đại hóa ngành hải quan.