Công văn 3813/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn nghiệp vụ cho các Cục Thuế địa phương về việc khấu trừ tiền bồi thường, hỗ trợ, tái định cư về đất vào tiền sử dụng đất, tiền thuê đất phải nộp của các dự án đầu tư trên cả nước.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất hoặc cho thuê đất, đã tự nguyện ứng trước tiền bồi thường, giải phóng mặt bằng theo phương án được cơ quan nhà nước có thẩm quyền phê duyệt. Hướng dẫn này giúp thống nhất cách hiểu và áp dụng pháp luật đất đai, thuế giữa cơ quan quản lý và người nộp thuế.

Nguyên tắc khấu trừ tiền bồi thường, hỗ trợ giải phóng mặt bằng

• Người được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất hoặc cho thuê đất nếu tự nguyện ứng trước tiền bồi thường, hỗ trợ, tái định cư theo phương án được phê duyệt thì được trừ số tiền đã ứng trước vào tiền sử dụng đất, tiền thuê đất phải nộp.
• Mức khấu trừ tối đa không vượt quá số tiền sử dụng đất, tiền thuê đất phải nộp cho Nhà nước.
• Trường hợp số tiền bồi thường, hỗ trợ, tái định cư đã ứng trước lớn hơn số tiền sử dụng đất, tiền thuê đất phải nộp thì phần chênh lệch còn lại sẽ được tính vào vốn đầu tư của dự án theo quy định của pháp luật đầu tư và xây dựng.

Xác định số tiền được khấu trừ vào nghĩa vụ tài chính

• Số tiền bồi thường, hỗ trợ, tái định cư được khấu trừ phải căn cứ trực tiếp vào phương án bồi thường, hỗ trợ, tái định cư đã được cơ quan nhà nước có thẩm quyền phê duyệt.
• Chỉ thực hiện khấu trừ đối với các khoản chi phí thực tế đã chi trả cho người bị thu hồi đất, có đầy đủ chứng từ, hóa đơn hợp pháp và được cơ quan chức năng xác nhận.
• Các khoản chi phí không thuộc phương án được duyệt hoặc không có chứng từ chứng minh hợp lệ sẽ không được chấp nhận để khấu trừ vào tiền sử dụng đất, tiền thuê đất.

Hồ sơ và thủ tục thực hiện khấu trừ

• Người nộp thuế có trách nhiệm chuẩn bị và nộp hồ sơ đề nghị khấu trừ đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp hoặc cơ quan có thẩm quyền xác định nghĩa vụ tài chính về đất đai.
• Hồ sơ cơ bản bao gồm: Quyết định giao đất hoặc cho thuê đất của cơ quan nhà nước; Phương án bồi thường, hỗ trợ, tái định cư được phê duyệt; Chứng từ chi trả tiền bồi thường, hỗ trợ; Văn bản xác nhận của cơ quan tài chính hoặc cơ quan được giao nhiệm vụ giải phóng mặt bằng về số tiền thực tế đã chi trả.

Trách nhiệm của cơ quan thuế và các đơn vị liên quan

• Cơ quan thuế có trách nhiệm chủ trì, phối hợp với các cơ quan tài chính, tài nguyên và môi trường tại địa phương để kiểm tra, đối chiếu hồ sơ đề nghị của người nộp thuế.
• Thực hiện xác định chính xác số tiền bồi thường, hỗ trợ được khấu trừ và ban hành thông báo nghĩa vụ tài chính về đất đai cho người nộp thuế theo đúng thời hạn quy định.
• Giải quyết kịp thời các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện khấu trừ, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của doanh nghiệp và tránh thất thu ngân sách nhà nước.

Hiệu lực và hướng dẫn thi hành

Công văn 3813/TCT-CS có hiệu lực thi hành kể từ ngày ban hành, đóng vai trò là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ nội bộ ngành Thuế, giúp các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thực hiện thống nhất các quy định pháp luật về đất đai và quản lý thuế hiện hành.