Công văn 3699/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về việc xác định ngành nghề kinh doanh của doanh nghiệp nhằm phục vụ công tác quản lý thuế, áp dụng chính sách ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp và giải quyết các vướng mắc thực tế của người nộp thuế.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản hướng dẫn áp dụng đối với cơ quan thuế các cấp trong quá trình thanh tra, kiểm tra thuế và các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế có hoạt động sản xuất, kinh doanh cần xác định rõ danh mục ngành nghề để thực hiện nghĩa vụ thuế theo đúng quy định pháp luật.

Nguyên tắc xác định ngành nghề kinh doanh thực tế

• Việc xác định ngành nghề kinh doanh của doanh nghiệp phải căn cứ vào hoạt động thực tế phát sinh doanh thu, chi phí và thu nhập, không chỉ dựa vào thông tin đăng ký trên Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.
• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự kê khai, tự nộp thuế và tự chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của ngành nghề kinh doanh thực tế mà mình đang vận hành.

Phối hợp giữa cơ quan thuế và cơ quan quản lý nhà nước có thẩm quyền

• Trong trường hợp phát sinh vướng mắc hoặc có sự không thống nhất về việc phân loại mã ngành kinh tế quốc dân, cơ quan thuế sẽ chủ động phối hợp với Sở Kế hoạch và Đầu tư hoặc các bộ, ngành quản lý chuyên môn để xác định rõ ngành nghề kinh doanh thực tế của doanh nghiệp.
• Kết quả xác định từ cơ quan quản lý chuyên ngành là cơ sở pháp lý quan trọng để cơ quan thuế áp dụng các chính sách quản lý thuế và ưu đãi thuế phù hợp.

Áp dụng chính sách ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

• Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (bao gồm thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế) chỉ được áp dụng đối với phần thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh đáp ứng đầy đủ các điều kiện ưu đãi theo quy định của pháp luật thuế và pháp luật đầu tư tại thời điểm phát sinh.
• Trường hợp doanh nghiệp thực hiện nhiều hoạt động sản xuất, kinh doanh khác nhau thì phải hạch toán riêng thu nhập từ hoạt động được hưởng ưu đãi thuế. Nếu không hạch toán riêng được, phần thu nhập ưu đãi sẽ được xác định theo tỷ lệ doanh thu hoặc các tiêu chí phân bổ hợp pháp khác theo quy định.
• Các khoản thu nhập từ hoạt động kinh doanh không thuộc ngành nghề được ưu đãi hoặc không đáp ứng điều kiện ưu đãi sẽ phải kê khai và nộp thuế thu nhập doanh nghiệp theo mức thuế suất phổ thông.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Công văn 3699/TCT-CS có hiệu lực hướng dẫn kể từ ngày ban hành. Tổng cục Thuế yêu cầu Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương căn cứ vào các quy định pháp luật hiện hành và hướng dẫn tại công văn này để hướng dẫn người nộp thuế thực hiện đúng quy định, đồng thời tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra nhằm phát hiện và xử lý nghiêm các trường hợp lợi dụng chính sách ưu đãi ngành nghề để trốn thuế, gian lận thuế.