Công văn 2928/TCT-NV5 do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng dành cho các Cục Thuế địa phương nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến chính sách miễn, giảm tiền thuê đất cho các dự án đầu tư. Văn bản này đóng vai trò định hướng, thống nhất quy trình áp dụng pháp luật thuế đất đai, đảm bảo quyền lợi hợp pháp cho doanh nghiệp đồng thời chống thất thu ngân sách nhà nước.

- Đối tượng và điều kiện áp dụng miễn, giảm tiền thuê đất

• Các dự án đầu tư thuộc lĩnh vực đặc biệt khuyến khích đầu tư hoặc thực hiện tại địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn được xem xét miễn tiền thuê đất cho cả thời hạn thuê hoặc một số năm nhất định.
• Các dự án xã hội hóa trong các lĩnh vực giáo dục, dạy nghề, y tế, văn hóa, thể thao và môi trường được hưởng các mức ưu đãi miễn, giảm tiền thuê đất theo quy định riêng của Chính phủ.
• Doanh nghiệp, tổ chức kinh tế thuê đất để thực hiện dự án sản xuất, kinh doanh phải có đầy đủ hồ sơ pháp lý về đất đai và dự án đầu tư được cơ quan nhà nước có thẩm quyền phê duyệt.

- Nguyên tắc xác định thời gian và mức miễn, giảm

• Việc miễn, giảm tiền thuê đất được thực hiện theo từng dự án đầu tư cụ thể và tính trên diện tích đất thực tế được Nhà nước cho thuê.
• Thời gian miễn tiền thuê đất trong thời gian xây dựng cơ bản được tính theo tiến độ thực tế của dự án nhưng tối đa không quá thời hạn quy định tại giấy phép đầu tư hoặc quyết định giao đất, thuê đất.
• Trường hợp một dự án đầu tư đáp ứng nhiều điều kiện ưu đãi miễn, giảm tiền thuê đất khác nhau thì chủ đầu tư được lựa chọn áp dụng mức ưu đãi cao nhất.

- Quy trình, thủ tục và thẩm quyền quyết định

• Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương có thẩm quyền ban hành quyết định miễn, giảm tiền thuê đất dựa trên hồ sơ đề nghị hợp lệ của người nộp thuế.
• Người nộp thuế có trách nhiệm tự xác định, kê khai và nộp hồ sơ đề nghị miễn, giảm tiền thuê đất đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp trong thời hạn quy định.
• Hồ sơ bắt buộc phải có quyết định cho thuê đất, hợp đồng thuê đất, biên bản bàn giao đất thực địa và các giấy tờ chứng minh đối tượng được hưởng ưu đãi đầu tư.

- Xử lý các trường hợp chuyển tiếp và nghĩa vụ tài chính liên quan

• Đối với các dự án đang trong thời gian được hưởng ưu đãi miễn, giảm tiền thuê đất theo các quy định trước đây thì tiếp tục thực hiện cho thời gian ưu đãi còn lại.
• Trường hợp người thuê đất không sử dụng đất đúng mục đích đã được quy định trong quyết định cho thuê đất hoặc vi phạm pháp luật đất đai sẽ bị thu hồi quyết định miễn, giảm và phải truy thu tiền thuê đất theo quy định.
• Khi có sự thay đổi về quy hoạch, mục đích sử dụng đất hoặc chuyển nhượng dự án, cơ quan thuế có trách nhiệm phối hợp với các cơ quan chức năng để xác định lại nghĩa vụ tài chính và mức ưu đãi mới phù hợp với thực tế.