Công văn số 1531/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành hướng dẫn chi tiết về công tác quyết toán thuế theo tỷ lệ nội địa hóa đối với các sản phẩm, phụ tùng thuộc ngành cơ khí, điện và điện tử. Đây là văn bản chỉ đạo quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc, thống nhất quy trình thực hiện và tăng cường quản lý nhà nước đối với chính sách ưu đãi thuế dựa trên tỷ lệ nội địa hóa sản phẩm.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các doanh nghiệp nhập khẩu linh kiện, phụ tùng để sản xuất, lắp ráp các sản phẩm cơ khí, điện, điện tử đăng ký hưởng ưu đãi thuế theo tỷ lệ nội địa hóa. Đồng thời, văn bản cũng quy định rõ trách nhiệm của Cục Hải quan các tỉnh, thành phố trong việc kiểm tra, giám sát và thực hiện quyết toán thuế cho các doanh nghiệp này.

- Nguyên tắc xác định và quyết toán thuế

• Việc quyết toán thuế phải được thực hiện dựa trên tỷ lệ nội địa hóa thực tế mà doanh nghiệp đạt được trong quá trình sản xuất, lắp ráp, đối chiếu trực tiếp với tỷ lệ đã đăng ký ban đầu với cơ quan có thẩm quyền.
• Cơ quan hải quan có trách nhiệm kiểm tra tính hợp pháp, hợp lệ của các chứng từ, hóa đơn, sổ sách kế toán và báo cáo kỹ thuật liên quan đến việc sản xuất sản phẩm để xác định chính xác số lượng linh kiện nhập khẩu đã được đưa vào sản xuất.

- Quy trình kiểm tra và nộp báo cáo quyết toán

• Doanh nghiệp có nghĩa vụ lập và nộp báo cáo quyết toán tình hình sử dụng linh kiện, phụ tùng nhập khẩu cùng báo cáo chi tiết về tỷ lệ nội địa hóa thực tế đạt được cho cơ quan hải quan quản lý trực tiếp theo đúng thời hạn quy định.
• Cơ quan hải quan thực hiện việc kiểm tra hồ sơ quyết toán tại trụ sở cơ quan hải quan hoặc tiến hành kiểm tra thực tế tại trụ sở, nhà xưởng của doanh nghiệp trong trường hợp cần làm rõ các nghi vấn về quy trình sản xuất hoặc tính xác thực của tỷ lệ nội địa hóa.

- Xử lý kết quả quyết toán và truy thu thuế

• Trong trường hợp kết quả kiểm tra cho thấy tỷ lệ nội địa hóa thực tế đạt được thấp hơn tỷ lệ doanh nghiệp đã đăng ký, dẫn đến việc áp dụng sai mức thuế suất ưu đãi, doanh nghiệp phải thực hiện nộp bổ sung phần thuế chênh lệch còn thiếu vào ngân sách nhà nước, đồng thời bị xử lý phạt chậm nộp theo quy định của pháp luật quản lý thuế.
• Nếu tỷ lệ nội địa hóa thực tế đạt được bằng hoặc cao hơn tỷ lệ đã đăng ký, doanh nghiệp được chính thức áp dụng mức thuế suất ưu đãi theo quy định tương ứng với nhóm tỷ lệ đó.

- Trách nhiệm và nghĩa vụ của doanh nghiệp

• Doanh nghiệp phải chịu hoàn toàn trách nhiệm trước pháp luật về tính trung thực, chính xác của các số liệu, tài liệu, hồ sơ kỹ thuật và báo cáo quyết toán đã nộp cho cơ quan hải quan.
• Doanh nghiệp có nghĩa vụ xuất trình đầy đủ sổ sách kế toán, chứng từ kho, quy trình công nghệ và các tài liệu liên quan khác khi có yêu cầu kiểm tra từ phía cơ quan hải quan.

- Trách nhiệm của cơ quan hải quan địa phương

• Cục Hải quan các tỉnh, thành phố có nhiệm vụ đôn đốc các doanh nghiệp trên địa bàn quản lý thực hiện nộp báo cáo quyết toán đúng hạn; chủ động phối hợp với các cơ quan quản lý chuyên ngành như Bộ Công Thương, Bộ Khoa học và Công nghệ để thẩm định, đánh giá tỷ lệ nội địa hóa khi phát hiện có sự không thống nhất.
• Tổng hợp các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện quyết toán thuế theo tỷ lệ nội địa hóa để kịp thời báo cáo, tham mưu cho Tổng cục Hải quan đưa ra phương án giải quyết thống nhất trên toàn quốc.

Hiệu lực thi hành

Công văn này có hiệu lực hướng dẫn thực hiện ngay từ ngày ban hành. Các đơn vị hải quan địa phương và doanh nghiệp liên quan có trách nhiệm nghiêm túc tuân thủ các nội dung hướng dẫn tại văn bản này để đảm bảo tính minh bạch, đúng quy định của pháp luật thuế và hải quan.