Thông tư liên tịch số 43/2005/TTLT/BTC-BQP được ban hành ngày 31 tháng 05 năm 2005 bởi Bộ Tài chính và Bộ Quốc phòng, hướng dẫn chi tiết về chính sách thuế và thu Ngân sách Nhà nước đối với hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ của các đơn vị thuộc Bộ Quốc phòng.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Thông tư này áp dụng đối với các đơn vị, tổ chức và doanh nghiệp thuộc Bộ Quốc phòng có phát sinh hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ, bao gồm:

• Các doanh nghiệp nhà nước thuộc Bộ Quốc phòng (bao gồm cả doanh nghiệp quốc phòng và doanh nghiệp kinh tế).
• Các đơn vị lực lượng vũ trang, đơn vị sự nghiệp có thu thuộc Bộ Quốc phòng có tổ chức hoạt động sản xuất, kinh doanh, dịch vụ.
• Các cơ quan, đơn vị quân đội khác có phát sinh nghĩa vụ nộp thuế và các khoản thu ngân sách theo quy định của pháp luật.

Chính sách thuế Giá trị gia tăng (GTGT)

• Đối với sản phẩm, dịch vụ phục vụ trực tiếp cho quốc phòng, an ninh theo danh mục do Bộ Quốc phòng và Bộ Tài chính thống nhất quy định thì thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Đối với sản phẩm, hàng hóa, dịch vụ sản xuất, kinh doanh thông thường không phục vụ mục đích quốc phòng, các đơn vị quân đội phải thực hiện kê khai, tính và nộp thuế GTGT theo quy định chung của Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Hướng dẫn cụ thể về phương pháp tính thuế (phương pháp khấu trừ thuế hoặc phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng) phù hợp với từng loại hình hoạt động của đơn vị quân đội.

Chính sách thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN)

• Các doanh nghiệp quân đội thực hiện nghĩa vụ nộp thuế TNDN theo quy định pháp luật hiện hành. Đối với các doanh nghiệp quốc phòng kết hợp làm kinh tế, được áp dụng các chính sách ưu đãi, miễn, giảm thuế TNDN đối với phần thu nhập từ hoạt động trực tiếp phục vụ quốc phòng, an ninh hoặc hoạt động tại các địa bàn chiến lược, vùng sâu, vùng xa, hải đảo.
• Thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ ngoài nhiệm vụ quốc phòng của các đơn vị lực lượng vũ trang phải chịu thuế TNDN theo thuế suất phổ thông.
• Quy định về việc quản lý, sử dụng phần thuế TNDN được để lại hoặc hỗ trợ đầu tư trở lại cho các nhiệm vụ quốc phòng theo cơ chế tài chính đặc thù của Bộ Quốc phòng.

Các khoản thuế, phí, lệ phí và nghĩa vụ tài chính khác

• Thuế tiêu thụ đặc biệt, thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu: Áp dụng theo quy định chung của pháp luật đối với các mặt hàng kinh doanh thương mại. Miễn thuế nhập khẩu đối với trang thiết bị, vũ khí, khí tài chuyên dùng phục vụ trực tiếp cho nhiệm vụ quốc phòng, an ninh trong nước chưa sản xuất được.
• Thuế tài nguyên và tiền thuê đất: Các đơn vị quân đội sử dụng đất vào mục đích quốc phòng được miễn tiền sử dụng đất, tiền thuê đất. Trường hợp sử dụng đất quốc phòng vào mục đích sản xuất, kinh doanh, dịch vụ thì phải nộp tiền thuê đất và các khoản thuế liên quan theo quy định của pháp luật đất đai và thuế tài nguyên.

Quản lý thu, nộp Ngân sách Nhà nước và quyết toán thuế

• Các đơn vị quân đội có hoạt động sản xuất, kinh doanh phải thực hiện đăng ký thuế, kê khai thuế, nộp thuế và quyết toán thuế trực tiếp với cơ quan thuế địa phương nơi đóng trụ sở hoặc theo hướng dẫn riêng của Bộ Quốc phòng và Bộ Tài chính.
• Quy định rõ trách nhiệm của cơ quan tài chính quân đội và cơ quan thuế các cấp trong việc phối hợp kiểm tra, đôn đốc thu nộp ngân sách, xử lý vi phạm về thuế đối với các đơn vị quân đội.

Hiệu lực thi hành

Thông tư liên tịch này có hiệu lực thi hành sau 15 ngày kể từ ngày đăng Công báo. Các quy định trước đây của Bộ Tài chính và Bộ Quốc phòng về chính sách thuế và thu ngân sách đối với các đơn vị quân đội trái với quy định tại Thông tư này đều bãi bỏ.