Công văn số 1136 TCT/ĐTNN được Tổng cục Thuế ban hành ngày 19/04/2004 nhằm hướng dẫn các cơ quan thuế địa phương và các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (ĐTNN) thực hiện thống nhất việc kê khai, khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT). Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm giải quyết các vướng mắc thực tế phát sinh trong quá trình áp dụng luật thuế GTGT tại thời điểm đó.

Đối tượng áp dụng và phạm vi điều chỉnh

Văn bản tập trung hướng dẫn công tác quản lý thuế đối với các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài hoạt động tại Việt Nam. Nội dung trọng tâm xoay quanh việc xác định tính hợp lệ của hóa đơn đầu vào và các điều kiện bắt buộc để doanh nghiệp được thực hiện khấu trừ thuế GTGT.

Nguyên tắc kê khai và khấu trừ thuế GTGT đầu vào

• Điều kiện khấu trừ thuế: Doanh nghiệp chỉ được khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ phục vụ trực tiếp cho hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT.
• Yêu cầu về chứng từ: Hóa đơn dùng để kê khai, khấu trừ phải là hóa đơn GTGT hợp pháp, ghi đúng và đầy đủ các chỉ tiêu theo quy định như tên, địa chỉ, mã số thuế của cả bên mua và bên bán, thuế suất và tiền thuế rõ ràng.
• Thời hạn kê khai: Doanh nghiệp có nghĩa vụ thực hiện kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào phát sinh trong tháng nào vào tờ khai thuế của chính tháng đó. Trường hợp có hóa đơn bị bỏ sót chưa kê khai, doanh nghiệp được phép kê khai bổ sung trong thời hạn quy định (tối đa là 3 tháng kể từ thời điểm phát sinh hóa đơn theo quy định pháp luật thuế thời kỳ này).

Xử lý các trường hợp đặc biệt và sai sót trong kê khai

• Hóa đơn kê khai muộn: Đối với các hóa đơn GTGT đầu vào phát sinh vượt quá thời hạn kê khai quy định (quá 3 tháng), doanh nghiệp không được đưa vào khấu trừ thuế GTGT đầu vào mà phải hạch toán vào chi phí hợp lý khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp hoặc xử lý theo các hướng dẫn cụ thể khác của Bộ Tài chính.
• Hóa đơn không hợp lệ: Các hóa đơn không đáp ứng đủ điều kiện về mặt pháp lý như hóa đơn giả, hóa đơn của doanh nghiệp đã bỏ trốn, hoặc hóa đơn có dấu hiệu tẩy xóa, sửa chữa sẽ bị loại khỏi diện được khấu trừ và doanh nghiệp sẽ bị xử lý vi phạm hành chính về thuế.

Trách nhiệm của cơ quan thuế và doanh nghiệp

• Đối với doanh nghiệp: Tự chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác, trung thực của số liệu kê khai trên tờ khai thuế GTGT cũng như tính hợp pháp của các hóa đơn, chứng từ dùng để khấu trừ.
• Đối với cơ quan thuế: Có trách nhiệm hướng dẫn, kiểm tra, giám sát chặt chẽ việc kê khai của doanh nghiệp; kịp thời phát hiện và xử lý nghiêm các hành vi gian lận thuế, khai khống hóa đơn nhằm chiếm đoạt tiền thuế của Nhà nước.