Tóm tắt Công văn 89564/CT-TTHT năm 2020 về kê khai thuế giá trị gia tăng đối với Chi nhánh

Công văn 89564/CT-TTHT do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành nhằm hướng dẫn các doanh nghiệp thực hiện đúng quy định về việc kê khai, nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các chi nhánh hoạt động phụ thuộc hoặc độc lập. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp doanh nghiệp phân định rõ trách nhiệm thuế giữa trụ sở chính và các đơn vị trực thuộc, tránh các sai sót pháp lý trong quá trình vận hành.

1. Nguyên tắc xác định nghĩa vụ kê khai thuế GTGT của chi nhánh

Việc xác định chi nhánh phải tự kê khai thuế GTGT hay kê khai tập trung tại trụ sở chính phụ thuộc vào các yếu tố bao gồm: hình thức hạch toán kế toán (độc lập hay phụ thuộc), địa bàn hoạt động (cùng tỉnh hay khác tỉnh với trụ sở chính) và việc có trực tiếp bán hàng, phát sinh doanh thu hay không. Cụ thể:

• Chi nhánh hạch toán độc lập: Bắt buộc phải đăng ký thuế, kê khai và nộp thuế GTGT trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp của chi nhánh, không phân biệt chi nhánh đó ở cùng tỉnh hay khác tỉnh với trụ sở chính.
• Chi nhánh hạch toán phụ thuộc: Việc kê khai thuế GTGT sẽ được phân loại chi tiết dựa trên địa giới hành chính và hoạt động thực tế của chi nhánh.

2. Quy định kê khai đối với chi nhánh hạch toán phụ thuộc cùng tỉnh, thành phố

Đối với các chi nhánh hạch toán phụ thuộc có địa chỉ trụ sở nằm trong cùng tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương với trụ sở chính của doanh nghiệp:

• Doanh nghiệp thực hiện kê khai thuế GTGT tập trung tại trụ sở chính cho cả hoạt động sản xuất kinh doanh của chi nhánh phụ thuộc.
• Trường hợp chi nhánh phụ thuộc có con dấu riêng, có tài khoản tiền gửi ngân hàng, trực tiếp bán hàng hóa, dịch vụ, kê khai đầy đủ thuế GTGT đầu vào, đầu ra và có nhu cầu kê khai nộp thuế riêng thì vẫn được phép đăng ký thuế, tự kê khai và nộp thuế GTGT riêng với cơ quan thuế quản lý trực tiếp của chi nhánh.

3. Quy định kê khai đối với chi nhánh hạch toán phụ thuộc khác tỉnh, thành phố

Đối với các chi nhánh hạch toán phụ thuộc nằm tại tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương khác với nơi đặt trụ sở chính:

• Trường hợp chi nhánh trực tiếp bán hàng, phát sinh doanh thu: Chi nhánh phải thực hiện nộp hồ sơ khai thuế GTGT cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp của chi nhánh. Chi nhánh sử dụng hóa đơn riêng và tự chịu trách nhiệm về nghĩa vụ thuế phát sinh.
• Trường hợp chi nhánh không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu: Doanh nghiệp thực hiện khai thuế GTGT tập trung tại trụ sở chính. Chi nhánh không phải nộp hồ sơ khai thuế GTGT tại địa phương nơi đặt chi nhánh.
• Đối với cơ sở sản xuất trực thuộc: Trường hợp chi nhánh là cơ sở sản xuất trực thuộc khác tỉnh nhưng không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu thì doanh nghiệp thực hiện khai thuế GTGT tập trung tại trụ sở chính và phân bổ số thuế GTGT phải nộp cho địa phương nơi có cơ sở sản xuất theo tỷ lệ quy định của pháp luật về quản lý thuế.

4. Hướng dẫn về hóa đơn và chứng từ đối với chi nhánh

Công văn cũng làm rõ việc sử dụng hóa đơn đối với các chi nhánh trong quá trình hoạt động:

• Các chi nhánh tự kê khai thuế GTGT phải thực hiện đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử hoặc hóa đơn tự in/đặt in theo đúng quy định pháp luật hiện hành tại thời điểm áp dụng.
• Việc luân chuyển hàng hóa giữa trụ sở chính và chi nhánh hạch toán phụ thuộc hoặc giữa các chi nhánh phụ thuộc với nhau phải sử dụng Phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ kèm theo Lệnh điều động nội bộ, hoặc sử dụng hóa đơn GTGT làm căn cứ thanh toán và kê khai thuế.

5. Khuyến nghị dành cho doanh nghiệp

Để đảm bảo tuân thủ đúng quy định tại Công văn 89564/CT-TTHT và các văn bản pháp luật liên quan, doanh nghiệp cần lưu ý:

• Rà soát kỹ quy chế hoạt động, hình thức hạch toán kế toán của từng chi nhánh để áp dụng phương thức kê khai thuế phù hợp.
• Thực hiện đăng ký phương thức khai thuế (tập trung hoặc riêng rẽ) với cơ quan thuế quản lý trực tiếp ngay từ khi thành lập chi nhánh hoặc khi có sự thay đổi về mô hình hoạt động.
• Theo dõi sát sao các hướng dẫn mới về quản lý thuế để cập nhật kịp thời các thay đổi về nghĩa vụ phân bổ thuế đối với đơn vị phụ thuộc khác tỉnh.