Tóm tắt Công văn 707/TCT-KK năm 2016 về hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư

Công văn 707/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn và giải quyết các vướng mắc của cơ quan thuế địa phương cũng như doanh nghiệp liên quan đến chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư. Đây là văn bản nghiệp vụ quan trọng giúp thống nhất quy trình kê khai, bù trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào phát sinh trong giai đoạn đầu tư.

1. Quy định về kê khai thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Theo hướng dẫn tại Công văn 707/TCT-KK, việc kê khai thuế GTGT đối với dự án đầu tư được thực hiện theo các nguyên tắc sau:

• Người nộp thuế đang hoạt động sản xuất kinh doanh có dự án đầu tư mới (tại cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương) phải thực hiện lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư.
• Doanh nghiệp sử dụng Mẫu tờ khai thuế GTGT dành cho dự án đầu tư (Mẫu số 02/GTGT) để phản ánh riêng biệt số thuế GTGT đầu vào phát sinh từ các hoạt động mua sắm hàng hóa, dịch vụ phục vụ cho dự án.
• Trường hợp doanh nghiệp thành lập Ban quản lý dự án trực tiếp quản lý dự án đầu tư thì Ban quản lý dự án thực hiện đăng ký thuế, kê khai và nộp thuế riêng theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.

2. Nguyên tắc bù trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư

Công văn làm rõ phương án xử lý số thuế GTGT đầu vào tích lũy trong giai đoạn đầu tư thông qua cơ chế bù trừ và hoàn thuế:

• Bù trừ thuế GTGT: Số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư phải được bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện của trụ sở chính (nếu có).
• Điều kiện về hạn mức hoàn thuế: Sau khi thực hiện bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được bù trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì doanh nghiệp được xem xét hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
• Xử lý số thuế dưới hạn mức: Trường hợp số thuế GTGT đầu vào chưa được bù trừ hết của dự án đầu tư dưới 300 triệu đồng thì doanh nghiệp không được hoàn thuế trong kỳ đó mà phải kết chuyển sang kỳ tính thuế tiếp theo của dự án đầu tư để tiếp tục theo dõi và bù trừ.

3. Điều kiện pháp lý để được hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Để được cơ quan thuế chấp thuận hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư, doanh nghiệp phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện nghiêm ngặt sau:

• Dự án đầu tư phải là dự án mới, đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh và chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế.
• Doanh nghiệp phải thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật về kế toán và hóa đơn, chứng từ.
• Phải thực hiện thanh toán không dùng tiền mặt đối với các hóa đơn mua vào có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên (bao gồm cả thuế GTGT) và có tài khoản ngân hàng đã đăng ký với cơ quan thuế.
• Dự án đầu tư phải được cơ quan nhà nước có thẩm quyền phê duyệt hoặc cấp Giấy chứng nhận đầu tư đối với các trường hợp bắt buộc phải có Giấy chứng nhận đầu tư theo quy định của pháp luật về đầu tư.

4. Thẩm quyền và thủ tục giải quyết hồ sơ hoàn thuế

Công văn 707/TCT-KK định hướng rõ trách nhiệm phối hợp và xử lý hồ sơ giữa các cơ quan thuế:

• Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương nơi người nộp thuế đóng trụ sở chính hoặc nơi có dự án đầu tư chịu trách nhiệm tiếp nhận, kiểm tra và giải quyết hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT của dự án đầu tư.
• Cơ quan thuế áp dụng nguyên tắc kiểm tra trước, hoàn thuế sau hoặc hoàn thuế trước, kiểm tra sau theo đúng quy định của Luật Quản lý thuế nhằm đảm bảo tính chính xác, hợp pháp của số thuế đề nghị hoàn.
• Doanh nghiệp có nghĩa vụ giải trình, cung cấp đầy đủ hồ sơ, tài liệu chứng minh nguồn gốc hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ cho dự án đầu tư khi có yêu cầu thanh tra, kiểm tra từ phía cơ quan thuế.