Công văn 6385/TCHQ-TXNK năm 2020 do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện trừ lùi Danh mục hàng hóa miễn thuế nhập khẩu. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng dành cho các Cục Hải quan tỉnh, thành phố và cộng đồng doanh nghiệp xuất nhập khẩu nhằm đảm bảo tính thống nhất, chính xác trong việc quản lý và áp dụng chính sách ưu đãi thuế.

Dưới đây là tóm tắt chi tiết các nội dung hướng dẫn cốt lõi tại Công văn 6385/TCHQ-TXNK:

- Nguyên tắc thực hiện trừ lùi Danh mục miễn thuế

• Việc trừ lùi số lượng, trị giá hàng hóa miễn thuế phải được thực hiện chủ yếu trên Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan (VNACCS/VCIS) ngay khi thông quan lô hàng.
• Trong trường hợp hệ thống gặp sự cố kỹ thuật hoặc đối với các tờ khai hải quan giấy được chấp nhận theo quy định, cơ quan hải quan thực hiện việc trừ lùi thủ công trên bản giấy của Danh mục miễn thuế và Phiếu theo dõi trừ lùi do doanh nghiệp xuất trình.
• Công chức hải quan thực hiện thủ tục phải ký xác nhận, ghi rõ ngày, tháng, năm và lượng hàng hóa đã thực tế nhập khẩu được miễn thuế vào Phiếu theo dõi trừ lùi.

- Hướng dẫn xử lý vướng mắc khi nhập khẩu tại nhiều Chi cục Hải quan

• Khi doanh nghiệp thực hiện thủ tục nhập khẩu hàng hóa miễn thuế tại nhiều Chi cục Hải quan khác nhau so với nơi đăng ký Danh mục miễn thuế, Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục nhập khẩu có trách nhiệm kiểm tra thông tin trên hệ thống.
• Trường hợp hệ thống điện tử chưa cập nhật kịp thời dữ liệu trừ lùi từ các Chi cục khác, doanh nghiệp phải xuất trình Phiếu theo dõi trừ lùi bản giấy để công chức hải quan đối chiếu, thực hiện trừ lùi thủ công nhằm tránh việc lợi dụng miễn thuế vượt định mức.
• Sau khi thực hiện trừ lùi thủ công, Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục phải cập nhật ngay thông tin vào hệ thống khi hệ thống hoạt động bình thường trở lại.

- Xử lý trường hợp sửa đổi, bổ sung Danh mục miễn thuế

• Trường hợp doanh nghiệp phát hiện sai sót hoặc cần điều chỉnh, bổ sung Danh mục miễn thuế đã đăng ký, doanh nghiệp phải thực hiện thủ tục sửa đổi trước thời điểm nhập khẩu lô hàng cuối cùng của Danh mục đó.
• Cơ quan hải quan nơi tiếp nhận đăng ký Danh mục miễn thuế ban đầu có thẩm quyền kiểm tra, phê duyệt nội dung sửa đổi trên hệ thống và phản hồi kết quả cho doanh nghiệp.
• Các lô hàng đã thông quan miễn thuế trước thời điểm sửa đổi Danh mục vẫn được bảo lưu kết quả trừ lùi theo đúng quy định tại thời điểm thông quan.

- Kiểm soát lượng hàng hóa nhập khẩu vượt định mức

• Hệ thống điện tử sẽ tự động khóa và từ chối thông quan đối với lượng hàng hóa vượt quá số lượng hoặc trị giá đã đăng ký trong Danh mục miễn thuế.
• Đối với lượng hàng hóa vượt định mức, doanh nghiệp không được áp dụng chính sách miễn thuế nhập khẩu mà phải thực hiện khai báo, nộp thuế theo quy định hiện hành đối với hàng hóa nhập khẩu thông thường.
• Trường hợp có sự sai lệch giữa số liệu trên hệ thống và số liệu thực tế do lỗi kỹ thuật, Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục phải phối hợp với bộ phận quản lý hệ thống để xác minh và điều chỉnh kịp thời cho doanh nghiệp.

- Trách nhiệm của các bên liên quan

• Đối với cơ quan hải quan: Tăng cường công tác kiểm tra, giám sát việc trừ lùi Danh mục miễn thuế; đảm bảo sự phối hợp chặt chẽ giữa Chi cục Hải quan nơi đăng ký danh mục và các Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục thông quan; kịp thời báo cáo Tổng cục Hải quan các sự cố hệ thống vượt thẩm quyền giải quyết.
• Đối với doanh nghiệp: Chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của thông tin khai báo; chủ động theo dõi sát sao lượng hàng hóa đã thực tế nhập khẩu và số dư còn lại trong Danh mục miễn thuế để thực hiện đúng quy định, tránh phát sinh nợ thuế hoặc vi phạm hành chính.