Công văn 493/TCT-KK năm 2015 do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn và giải đáp các vướng mắc liên quan đến việc lập, nộp hồ sơ khai bổ sung hồ sơ khai thuế, điều chỉnh số liệu thuế giá trị gia tăng (GTGT) và xử lý nghĩa vụ thuế phát sinh của người nộp thuế.

1. Nguyên tắc thực hiện khai bổ sung hồ sơ khai thuế

• Người nộp thuế khi phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sự sai sót, sai lệch số liệu làm ảnh hưởng đến số thuế phải nộp hoặc số thuế được khấu trừ, được hoàn thì được phép khai bổ sung hồ sơ khai thuế.
• Thời hạn khai bổ sung được thực hiện vào bất kỳ ngày làm việc nào, không phụ thuộc vào thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế tiếp theo, nhưng phải trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.

2. Hướng dẫn xử lý các trường hợp khai bổ sung cụ thể

• Khai bổ sung làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế đã được hoàn: Người nộp thuế thực hiện nộp đủ số tiền thuế tăng thêm hoặc số tiền thuế đã được hoàn thừa vào ngân sách nhà nước, đồng thời tự xác định và nộp số tiền chậm nộp căn cứ trên số tiền thuế chênh lệch và số ngày chậm nộp.
• Khai bổ sung làm giảm số thuế phải nộp hoặc tăng số thuế được hoàn: Số thuế chênh lệch giảm phải nộp hoặc tăng được hoàn sẽ được cơ quan thuế bù trừ vào số thuế phải nộp của các kỳ tiếp theo hoặc thực hiện hoàn trả theo quy định của pháp luật.
• Điều chỉnh chỉ tiêu thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau:
  • Nếu khai bổ sung làm giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ của kỳ phát sinh sai sót: Người nộp thuế kê khai điều chỉnh giảm chỉ tiêu này vào Tờ khai thuế GTGT của kỳ tính thuế hiện tại (kỳ lập hồ sơ khai bổ sung).
  • Nếu khai bổ sung làm tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ của kỳ phát sinh sai sót: Người nộp thuế điều chỉnh tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ tại kỳ sai sót để theo dõi, chuyển trừ dần hoặc làm thủ tục hoàn thuế nếu đáp ứng đủ điều kiện.

3. Khai bổ sung sau khi có quyết định kiểm tra, thanh tra thuế

• Trường hợp người nộp thuế phát hiện sai sót sau khi cơ quan thuế đã công bố quyết định kiểm tra, thanh tra thuế tại trụ sở, người nộp thuế vẫn được thực hiện khai bổ sung.
• Việc xử lý số liệu khai bổ sung và các hình thức xử phạt vi phạm hành chính về thuế, tính tiền chậm nộp liên quan đến nội dung kiểm tra, thanh tra sẽ được thực hiện theo biên bản, kết luận và quyết định xử lý của cơ quan có thẩm quyền.

4. Thành phần hồ sơ khai bổ sung

• Tờ khai thuế của kỳ tính thuế có sai sót đã được điều chỉnh, bổ sung lại số liệu chính xác.
• Bản giải trình khai bổ sung, điều chỉnh theo mẫu quy định (Mẫu số 01/KHBS).
• Các tài liệu, hóa đơn, chứng từ kèm theo chứng minh cho các số liệu điều chỉnh, bổ sung.