Công văn 3851/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến việc xác định ngành nghề ưu đãi đầu tư để áp dụng chính sách ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Văn bản này hướng dẫn các cơ quan thuế địa phương và doanh nghiệp thực hiện thống nhất các quy định pháp luật về thuế và đầu tư đối với các dự án có ngành nghề thuộc danh mục ưu đãi.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các cơ quan thuế các cấp, các doanh nghiệp có dự án đầu tư mới hoặc dự án đầu tư mở rộng đang gặp vướng mắc trong việc xác định điều kiện hưởng ưu đãi thuế TNDN theo ngành nghề kinh doanh thực tế.

Nguyên tắc xác định ngành nghề ưu đãi đầu tư

• Doanh nghiệp phải có dự án đầu tư thực tế hoạt động trong lĩnh vực, ngành nghề thuộc Danh mục địa bàn ưu đãi đầu tư hoặc Danh mục ngành, nghề ưu đãi đầu tư theo quy định của Luật Đầu tư và các văn bản hướng dẫn thi hành.
• Việc xác định ưu đãi thuế TNDN phải căn cứ vào hoạt động sản xuất, kinh doanh thực tế của dự án đầu tư, không chỉ dựa trên giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp.
• Doanh nghiệp phải thực hiện chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định và nộp thuế theo kê khai để làm cơ sở tính hưởng ưu đãi thuế.

Sự phối hợp giữa Cơ quan Thuế và Cơ quan Quản lý Đầu tư

• Trong trường hợp có sự chưa rõ ràng hoặc tranh chấp về việc xác định ngành nghề thực tế của doanh nghiệp có thuộc danh mục ưu đãi đầu tư hay không, cơ quan thuế sẽ chủ động phối hợp, lấy ý kiến bằng văn bản từ cơ quan quản lý nhà nước về đầu tư (như Sở Kế hoạch và Đầu tư hoặc Ban quản lý các khu công nghiệp, khu chế xuất) để làm căn cứ xử lý.
• Ý kiến chuyên môn của cơ quan quản lý đầu tư là cơ sở pháp lý quan trọng để cơ quan thuế xem xét, quyết định việc áp dụng hoặc không áp dụng ưu đãi thuế TNDN cho doanh nghiệp.

Trách nhiệm của doanh nghiệp trong việc kê khai ưu đãi

• Doanh nghiệp tự xác định các điều kiện ưu đãi thuế, mức thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế và số lỗ được chuyển trừ vào thu nhập chịu thuế để tự kê khai và tự chịu trách nhiệm trước pháp luật.
• Trường hợp cơ quan thuế qua thanh tra, kiểm tra phát hiện doanh nghiệp không đáp ứng đủ điều kiện hưởng ưu đãi hoặc kê khai không chính xác ngành nghề ưu đãi, doanh nghiệp sẽ bị truy thu thuế và xử phạt vi phạm hành chính về thuế theo quy định hiện hành.

Hiệu lực thi hành

Công văn 3851/TCT-CS mang tính chất hướng dẫn nghiệp vụ dựa trên các quy định pháp luật về thuế TNDN và pháp luật về đầu tư hiện hành tại thời điểm ban hành. Các cơ quan thuế địa phương căn cứ vào hướng dẫn này và tình hình thực tế của người nộp thuế để thực hiện đúng quy định.