Công văn 3375/TCT-KK được Tổng cục Thuế ban hành năm 2014 nhằm giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình quản lý, kê khai và nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hoạt động kinh doanh vãng lai ngoại tỉnh. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp các cơ quan thuế địa phương thống nhất phương án xử lý, đồng thời hỗ trợ người nộp thuế thực hiện đúng nghĩa vụ tài chính mà không bị đánh thuế trùng lặp.

Nguyên tắc xử lý khi người nộp thuế chưa nộp thuế GTGT vãng lai ngoại tỉnh

Đối với các trường hợp người nộp thuế có hoạt động xây dựng, lắp đặt, bán hàng vãng lai ngoại tỉnh thuộc diện phải nộp thuế GTGT tại địa phương nơi phát sinh hoạt động nhưng chưa thực hiện nghĩa vụ này, Tổng cục Thuế hướng dẫn xử lý như sau:

• Trường hợp đã nộp đủ thuế tại trụ sở chính: Nếu người nộp thuế đã kê khai và nộp đầy đủ số thuế GTGT phát sinh của hoạt động vãng lai tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp của trụ sở chính, cơ quan thuế nơi có hoạt động vãng lai sẽ phối hợp với cơ quan thuế quản lý trụ sở chính để thực hiện bù trừ nghĩa vụ thuế. Người nộp thuế phải thực hiện kê khai điều chỉnh lại hồ sơ thuế, tuy nhiên sẽ không bị phạt chậm nộp đối với số thuế đã nộp đủ tại trụ sở chính.
• Trường hợp chưa kê khai và chưa nộp thuế ở cả hai nơi: Người nộp thuế sẽ bị xác định là vi phạm pháp luật về thuế. Cơ quan thuế nơi phát sinh hoạt động vãng lai có quyền truy thu số thuế GTGT vãng lai chưa nộp, đồng thời áp dụng các biện pháp xử phạt vi phạm hành chính về thuế và tính tiền chậm nộp theo quy định của Luật Quản lý thuế.

Hướng dẫn kê khai khấu trừ thuế GTGT vãng lai tại trụ sở chính

Để đảm bảo quyền lợi khấu trừ thuế của doanh nghiệp, Công văn 3375/TCT-KK hướng dẫn chi tiết quy trình khấu trừ số thuế GTGT vãng lai đã nộp tại địa phương khác:

• Căn cứ khấu trừ: Người nộp thuế sử dụng chứng từ nộp tiền thuế GTGT vãng lai ngoại tỉnh (chứng từ nộp tiền vào ngân sách nhà nước) để làm căn cứ kê khai, khấu trừ vào số thuế GTGT phải nộp trên tờ khai thuế tại trụ sở chính.
• Phương thức kê khai: Số thuế GTGT vãng lai đã nộp được thể hiện trên bảng kê và đưa vào chỉ tiêu tương ứng trên tờ khai thuế GTGT (mẫu số 01/GTGT) của kỳ tính thuế phát sinh tại trụ sở chính.
• Xử lý chậm kê khai khấu trừ: Trong trường hợp doanh nghiệp đã nộp thuế vãng lai nhưng chậm trễ trong việc kê khai khấu trừ tại trụ sở chính, cơ quan thuế hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện kê khai bổ sung, điều chỉnh theo đúng quy định pháp luật để được hoàn thuế hoặc bù trừ vào các kỳ tiếp theo.

Trách nhiệm phối hợp giữa các cơ quan thuế địa phương

Công văn nhấn mạnh việc nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước thông qua cơ chế phối hợp chặt chẽ giữa cơ quan thuế nơi quản lý trụ sở chính và cơ quan thuế nơi phát sinh hoạt động vãng lai:

• Trao đổi và xác minh thông tin: Cơ quan thuế nơi có hoạt động vãng lai có trách nhiệm đôn đốc người nộp thuế thực hiện nghĩa vụ, đồng thời gửi thông báo bằng văn bản cho cơ quan thuế quản lý trụ sở chính để kiểm tra, đối chiếu số liệu kê khai của doanh nghiệp.
• Thực hiện bù trừ thu ngân sách: Hai cơ quan thuế liên quan phải chủ động phối hợp thực hiện các thủ tục điều chỉnh, bù trừ số thu ngân sách giữa các địa phương một cách chính xác, nhanh chóng, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của doanh nghiệp và tránh thất thu ngân sách nhà nước.