1. Nghiên cứu và trình Hội đồng Chính phủ ban hành các chính sách, thể lệ về y tế; tổ chức và chỉ đạo thực hiện các chính sách, thể lệ ấy.

2. Nghiên cứu và trình Hội đồng Chính phủ phê chuẩn kế hoạch phát triển sự nghiệp y tế; tổ chức và chỉ đạo thực hiện kế hoạch ấy.

3. Tổ chức và chỉ đạo mọi công tác vệ sinh, phòng bệnh, phòng dịch, chữa bệnh, bảo vệ bà mẹ và trẻ em.

4. Quản lý công tác sản xuất, phân phối thuốc và dụng cụ y tế.

5. Nghiên cứu khoa học, kỹ thuật về y và dược

6. Thi hành các hiệp định mà nước ta đã ký kết với nước ngoài về mặt y tế.

7. Xét duyệt các thiết kế, thiết bị vệ sinh, phòng bệnh của các công trình xây dựng ở thành thị và nông thôn, các công trình xây dựng, công nghiệp và dân dụng, để bảo đảm, sức khỏe cho công nhân, cán bộ, nhân viên và nhân dân.

8. Quyết định các biện pháp cần thiết để bảo đảm thực hiện luật lệ vệ sinh đối với thành phố, nông thôn, xí nghiệp, công trường, nông trường, lâm trường, trường học và nhà ăn công cộng, đường giao thông để phòng dịch, chống dịch, ngăn ngừa dịch ở nước ngoài vào qua các biên giới, cửa bể và sân bay.

9. Quản lý các cơ sở sự nghiệp, doanh nghiệp và xí nghiệp trực thuộc Bộ; chỉ đạo về mặt nghiệp vụ các cơ sở sự nghiệp, doanh nghiệp và xí nghiệp y tế ở các địa phương và các ngành khác.

10. Theo dõi và giúp đỡ Hội đông y về mặt hoạt động nghiệp vụ, chuyên môn để tăng cường việc kết hợp chặt chẽ đông y với tây y trong công tác y tế.

11. Theo dõi và hướng dẫn Hội y học về mặt nghiên cứu và phổ biến khoa học kỹ thuật về y và dược.

12. Quản lý tổ chức cán bộ, biên chế, lao động tiền lương, tài sản, tài vụ, vật tư v.v… trong ngành theo chế độ chung của Nhà nước

- Đào tạo, bổ túc cán bộ chuyên môn kỹ thuật của ngành.