Tóm tắt Công văn số 504 TCT/PCCS ngày 01/03/2004 của Tổng cục Thuế về việc khấu trừ thuế GTGT mặt hàng giống cây trồng

Công văn số 504 TCT/PCCS được Tổng cục Thuế ban hành nhằm giải quyết các vướng mắc và hướng dẫn đồng bộ chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT), đặc biệt là cơ chế khấu trừ thuế đầu vào đối với mặt hàng giống cây trồng. Đây là văn bản nghiệp vụ quan trọng giúp các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực nông nghiệp và cơ quan thuế các địa phương thực hiện đúng quy định pháp luật thuế tại thời điểm ban hành.

- Chính sách thuế GTGT đối với mặt hàng giống cây trồng

• Khâu sản xuất, tự trồng trọt bán ra: Theo quy định pháp luật về thuế GTGT, các sản phẩm trồng trọt (bao gồm cả giống cây trồng) do các tổ chức, cá nhân tự sản xuất, gieo trồng và bán ra thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT. Quy định này nhằm khuyến khích phát triển sản xuất nông nghiệp từ khâu gốc.
• Khâu kinh doanh thương mại: Đối với các doanh nghiệp, hợp tác xã hoặc hộ kinh doanh mua đi bán lại mặt hàng giống cây trồng (khâu thương mại), mặt hàng này phải chịu thuế GTGT theo mức thuế suất quy định đối với nhóm hàng hóa phục vụ sản xuất nông nghiệp.

- Nguyên tắc và điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào

• Trường hợp mua giống cây trồng từ người trực tiếp sản xuất: Khi doanh nghiệp thu mua giống cây trồng trực tiếp từ người dân hoặc các cơ sở tự sản xuất bán ra, do sản phẩm ở khâu này không chịu thuế GTGT nên người bán không xuất hóa đơn GTGT mà chỉ lập bảng kê thu mua. Vì vậy, doanh nghiệp mua vào không có căn cứ thuế GTGT đầu vào để thực hiện kê khai, khấu trừ.
• Trường hợp mua giống cây trồng từ cơ sở kinh doanh thương mại: Khi doanh nghiệp mua giống cây trồng từ các đơn vị kinh doanh thương mại có hóa đơn GTGT hợp pháp, số thuế GTGT đầu vào ghi trên hóa đơn sẽ được kê khai và khấu trừ toàn bộ nếu đáp ứng các điều kiện về chứng từ theo quy định.
• Yêu cầu về hạch toán và phân bổ thuế đầu vào: Đối với các doanh nghiệp vừa có hoạt động sản xuất kinh doanh chịu thuế GTGT, vừa có hoạt động không chịu thuế GTGT, doanh nghiệp phải thực hiện hạch toán riêng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không được khấu trừ. Trường hợp không hạch toán riêng được thì thuế đầu vào được phân bổ theo tỷ lệ doanh thu giữa hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT.

- Hướng dẫn thực hiện đối với cơ quan thuế và người nộp thuế

• Đối với cơ quan thuế địa phương: Cần tăng cường công tác kiểm tra, đối chiếu hóa đơn, chứng từ mua bán giống cây trồng nhằm ngăn chặn hành vi khai khống hóa đơn hoặc sử dụng bảng kê thu mua không đúng thực tế để gian lận hoàn thuế hoặc khấu trừ thuế.
• Đối với doanh nghiệp: Phải hoàn thiện hệ thống sổ sách kế toán, lưu trữ đầy đủ hóa đơn GTGT đầu vào, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt (đối với các giao dịch đạt hạn mức quy định) và bảng kê thu mua hợp lệ để làm cơ sở giải trình khi cơ quan thuế thực hiện thanh tra, quyết toán thuế.