Công văn số 2879/TCT-ĐTNN do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn chi tiết về chính sách và thủ tục hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án sử dụng nguồn vốn Hỗ trợ phát triển chính thức (ODA). Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp các chủ dự án, nhà thầu và cơ quan thuế địa phương thống nhất phương án xử lý hoàn thuế, đảm bảo quyền lợi cho các bên tham gia dự án ODA theo đúng quy định pháp luật.

- Đối tượng được áp dụng hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA

Văn bản xác định rõ các đối tượng cụ thể được hưởng chính sách hoàn thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa, dịch vụ mua trong nước phục vụ cho dự án ODA bao gồm:

• Chủ dự án ODA không hoàn lại: Các chủ chương trình, dự án hoặc nhà thầu chính được phía nhà tài trợ nước ngoài chỉ định quản lý và thực hiện dự án ODA viện trợ không hoàn lại được hoàn trả số thuế GTGT đã trả khi mua hàng hóa, dịch vụ tại Việt Nam.
• Văn phòng đại diện nhà tài trợ dự án ODA: Văn phòng đại diện của các tổ chức quốc tế, nhà tài trợ thực hiện các hoạt động quản lý, giám sát dự án ODA phi chính phủ hoặc ODA của các chính phủ nước ngoài tại Việt Nam.
• Nhà thầu chính nước ngoài: Nhà thầu nước ngoài trực tiếp ký hợp đồng với chủ dự án ODA để thực hiện các gói thầu xây lắp, cung cấp thiết bị, dịch vụ cho dự án ODA thuộc diện được hoàn thuế.

- Điều kiện và nguyên tắc xét hoàn thuế GTGT

Để được cơ quan thuế chấp thuận hoàn thuế GTGT, các đơn vị thực hiện dự án ODA phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện nghiêm ngặt sau:

• Xác nhận viện trợ: Dự án phải được phê duyệt bởi cơ quan có thẩm quyền và có văn bản xác nhận viện trợ không hoàn lại hoặc xác nhận nguồn vốn ODA từ Bộ Tài chính hoặc cơ quan quản lý nhà nước liên quan.
• Hóa đơn và chứng từ hợp lệ: Toàn bộ hàng hóa, dịch vụ mua vào phải có hóa đơn GTGT hợp pháp, ghi rõ tên, địa chỉ, mã số thuế của chủ dự án hoặc nhà thầu chính.
• Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt: Các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng theo đúng quy định pháp luật về thuế GTGT.
• Hợp đồng ký kết rõ ràng: Hợp đồng giữa chủ dự án và nhà thầu chính phải thể hiện rõ giá thanh toán không bao gồm thuế GTGT hoặc thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT để làm cơ sở hoàn thuế cho nhà thầu hoặc chủ dự án tương ứng.

- Hồ sơ và thủ tục đề nghị hoàn thuế GTGT

Quy trình nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA được thực hiện tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp với các đầu mục hồ sơ bắt buộc:

• Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước: Sử dụng mẫu đơn theo quy định hiện hành của Luật Quản lý thuế.
• Bản sao quyết định phê duyệt dự án: Quyết định phê duyệt dự án ODA của cơ quan có thẩm quyền kèm theo văn kiện dự án đã được phê duyệt.
• Bảng kê hóa đơn, chứng từ: Danh mục chi tiết các hóa đơn GTGT mua vào của hàng hóa, dịch vụ đề nghị hoàn thuế.
• Văn bản xác nhận của cơ quan chủ quản: Xác nhận về việc dự án sử dụng nguồn vốn ODA không hoàn lại hoặc vốn vay ưu đãi thuộc diện được hoàn thuế GTGT đầu vào.

- Một số lưu ý quan trọng trong quá trình thụ lý hồ sơ

Công văn cũng nhấn mạnh một số điểm cần lưu ý đối với cả người nộp thuế và cơ quan thuế địa phương:

• Phân định rõ nguồn vốn: Trường hợp dự án hỗn hợp (sử dụng cả vốn ODA và vốn đối ứng trong nước), chỉ phần thuế GTGT đầu vào tương ứng với phần vốn ODA không hoàn lại mới được xem xét hoàn thuế theo quy định này.
• Thời hạn giải quyết hồ sơ: Cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu và giải quyết hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế theo đúng thời hạn quy định của Luật Quản lý thuế đối với diện "hoàn thuế trước, kiểm tra sau" hoặc "kiểm tra trước, hoàn thuế sau".
• Trách nhiệm pháp lý: Chủ dự án và nhà thầu chính phải chịu trách nhiệm hoàn toàn trước pháp luật về tính chính xác, trung thực của các số liệu, hóa đơn và chứng từ đã kê khai trong hồ sơ hoàn thuế.