Công văn 7643/TCHQ-TXNK do Tổng cục Hải quan ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng, giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện thủ tục đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế của doanh nghiệp và cơ quan hải quan địa phương. Dưới đây là tóm tắt chi tiết các nội dung cốt lõi của văn bản:

- Đối tượng và phạm vi áp dụng quy định đăng ký danh mục miễn thuế

• Áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân thực hiện dự án ưu đãi đầu tư hoặc các trường hợp được miễn thuế nhập khẩu theo quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu.
• Xác định rõ thẩm quyền tiếp nhận, xử lý hồ sơ đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế thuộc về Cục Hải quan nơi quản lý địa bàn thực hiện dự án hoặc nơi đóng trụ sở chính của doanh nghiệp.

- Quy trình tiếp nhận và kiểm tra hồ sơ đăng ký của cơ quan Hải quan

• Doanh nghiệp thực hiện khai báo và gửi hồ sơ đăng ký danh mục hàng hóa miễn thuế thông qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử của ngành Hải quan.
• Cơ quan hải quan có trách nhiệm kiểm tra tính đầy đủ, hợp lệ của hồ sơ, đối chiếu danh mục hàng hóa đăng ký với mục tiêu, quy mô, công suất của dự án đầu tư để đảm bảo tính phù hợp.
• Trường hợp hồ sơ chưa đầy đủ hoặc cần làm rõ, cơ quan hải quan phải thông báo kịp thời bằng văn bản hoặc qua hệ thống điện tử để doanh nghiệp bổ sung, giải trình.

- Nguyên tắc quản lý, sử dụng và trừ lùi danh mục hàng hóa miễn thuế

• Việc đăng ký danh mục hàng hóa miễn thuế phải được thực hiện trước khi nhập khẩu lô hàng đầu tiên của danh mục.
• Hệ thống điện tử sẽ tự động thực hiện việc theo dõi và trừ lùi số lượng, trị giá hàng hóa thực tế nhập khẩu dựa trên danh mục đã được phê duyệt.
• Trường hợp doanh nghiệp có nhu cầu sửa đổi, bổ sung danh mục đã đăng ký, thủ tục điều chỉnh phải được thực hiện trước thời điểm nhập khẩu lô hàng có sự thay đổi đó.

- Trách nhiệm của người nộp thuế và cơ quan Hải quan địa phương

• Người nộp thuế chịu trách nhiệm hoàn toàn trước pháp luật về tính chính xác, trung thực của các thông tin, tài liệu đã khai báo và cam kết sử dụng hàng hóa nhập khẩu đúng mục đích miễn thuế.
• Cục Hải quan các tỉnh, thành phố có trách nhiệm tăng cường công tác kiểm tra sau thông quan đối với các dự án đã được duyệt danh mục miễn thuế nhằm kịp thời phát hiện và xử lý nghiêm các hành vi sử dụng sai mục đích hoặc tẩu tán hàng hóa miễn thuế.