Công văn 6336/CT-TTHT do Cục Thuế Thành phố Hồ Chí Minh ban hành năm 2014 hướng dẫn chi tiết về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với khoản phí bảo vệ môi trường. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp các doanh nghiệp xác định đúng nghĩa vụ thuế đối với các khoản phí phát sinh trong quá trình hoạt động sản xuất, kinh doanh liên quan đến môi trường.

- Quy định về giá tính thuế giá trị gia tăng đối với phí bảo vệ môi trường

Căn cứ vào các quy định pháp luật về thuế GTGT hiện hành, đặc biệt là các hướng dẫn tại Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính, Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh đưa ra nguyên tắc xác định giá tính thuế như sau:

• Giá tính thuế GTGT đối với hàng hóa, dịch vụ là giá bán chưa có thuế GTGT, đã bao gồm các khoản phụ thu và phí phụ trội ngoài giá bán mà cơ sở kinh doanh được hưởng theo quy định.
• Đối với khoản phí bảo vệ môi trường được thu theo đúng quy định của pháp luật về phí và lệ phí, khoản tiền này bản chất là nguồn thu nộp vào ngân sách nhà nước và không tính vào doanh thu của doanh nghiệp. Do đó, khoản phí bảo vệ môi trường này không thuộc đối tượng chịu thuế GTGT và không phải tính vào giá tính thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ liên quan.
• Trường hợp doanh nghiệp thực hiện thu hộ phí bảo vệ môi trường cho cơ quan nhà nước theo quy định của pháp luật, khoản thu hộ này không phải kê khai, tính thuế GTGT khi lập hóa đơn.

- Hướng dẫn thực hiện và lập hóa đơn đối với doanh nghiệp

Để áp dụng đúng chính sách thuế và tránh các sai sót trong quá trình thực hiện, các doanh nghiệp cần lưu ý các hướng dẫn cụ thể sau:

• Tách biệt khoản phí trên hóa đơn: Khi lập hóa đơn GTGT cho hàng hóa, dịch vụ có kèm theo phí bảo vệ môi trường (ví dụ như nước sinh hoạt, hoạt động khai thác khoáng sản), doanh nghiệp phải thể hiện rõ ràng dòng thuế suất và tiền thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ chính. Khoản phí bảo vệ môi trường phải được ghi nhận riêng biệt trên hóa đơn và không chịu thuế GTGT.
• Hạch toán kế toán: Doanh nghiệp có trách nhiệm theo dõi, hạch toán riêng khoản phí bảo vệ môi trường thu hộ để nộp vào ngân sách nhà nước theo đúng quy định của pháp luật về phí và lệ phí, không được gộp chung vào doanh thu tính thuế thu nhập doanh nghiệp và doanh thu tính thuế GTGT của đơn vị.
• Trách nhiệm của cơ sở kinh doanh: Doanh nghiệp phải tự chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của các khoản phí bảo vệ môi trường thu hộ, đảm bảo thu đúng đối tượng và đúng mức phí do cơ quan nhà nước có thẩm quyền ban hành.

- Ý nghĩa pháp lý của văn bản hướng dẫn

Văn bản hướng dẫn này mang lại sự rõ ràng trong việc thực thi pháp luật thuế, giúp:

• Tránh việc đánh thuế trùng lặp (thuế chồng thuế) đối với các khoản phí mang tính chất nghĩa vụ tài chính nộp ngân sách nhà nước.
• Tạo điều kiện thuận lợi cho doanh nghiệp trong việc lập hóa đơn, chứng từ và kê khai thuế GTGT một cách chính xác, hạn chế tối đa rủi ro bị xử phạt vi phạm hành chính về thuế.
• Đảm bảo tính đồng bộ trong việc áp dụng luật thuế GTGT và luật phí, lệ phí tại địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh nói riêng và cả nước nói chung.