Công văn 5953/TCHQ-TXNK năm 2013 là văn bản nghiệp vụ quan trọng do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm ghi nhận, tổng hợp và đưa ra hướng dẫn giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện thủ tục hải quan. Văn bản này tập trung tháo gỡ các khó khăn liên quan đến chính sách thuế xuất nhập khẩu, phân loại hàng hóa và áp dụng mức thuế đối với cộng đồng doanh nghiệp và các chi cục hải quan địa phương.

Ghi nhận và xử lý vướng mắc về phân loại hàng hóa (Mã HS)

• Tổng cục Hải quan ghi nhận các phản ánh về tình trạng thiếu thống nhất trong việc áp mã số HS đối với một số nhóm mặt hàng nhập khẩu phức tạp, dễ gây tranh chấp giữa doanh nghiệp và cơ quan hải quan.
• Yêu cầu các Cục Hải quan địa phương khi thực hiện phân loại hàng hóa phải căn cứ nghiêm ngặt vào Danh mục hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu Việt Nam, Sáu quy tắc tổng quát giải thích Hệ thống HS và các Chú giải chi tiết kèm theo.
• Đối với các trường hợp mặt hàng mới hoặc mặt hàng có cấu tạo phức tạp chưa được định danh rõ ràng, các đơn vị phải báo cáo chi tiết kèm mẫu vật hoặc tài liệu kỹ thuật về Tổng cục để được hướng dẫn phân loại thống nhất trên toàn quốc.

Giải quyết vướng mắc về chính sách thuế, miễn thuế và hoàn thuế

• Làm rõ các điều kiện, hồ sơ và thủ tục xét miễn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu tạo tài sản cố định của các dự án thuộc diện ưu đãi đầu tư, đảm bảo đúng đối tượng và tránh thất thu ngân sách nhà nước.
• Hướng dẫn cụ thể về quy trình, thủ tục hoàn thuế đối với nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu, đặc biệt là việc xử lý các vướng mắc liên quan đến chứng từ thanh toán qua ngân hàng.
• Quy định nguyên tắc áp dụng thuế suất ưu đãi (MFN) và thuế suất ưu đãi đặc biệt (FTA) trong trường hợp có sự khác biệt về thời điểm nộp chứng nhận xuất xứ hàng hóa (C/O).

Tăng cường quản lý và tổ chức thực hiện tại các địa phương

• Yêu cầu Cục trưởng Cục Hải quan các tỉnh, thành phố chỉ đạo sát sao công tác đối thoại, tiếp xúc doanh nghiệp để kịp thời nắm bắt và giải quyết các vướng mắc phát sinh ngay tại khâu thông quan.
• Đẩy mạnh sự phối hợp chặt chẽ giữa bộ phận kiểm tra sau thông quan và bộ phận quản lý thuế nhằm phát hiện, xử lý kịp thời các hành vi gian lận thương mại qua giá, lượng và mã số thuế.
• Nghiêm cấm các hành vi tự ý kéo dài thời gian giải quyết hồ sơ hoàn thuế, miễn thuế của doanh nghiệp mà không có lý do chính đáng hoặc không đúng thẩm quyền quy định.