Công văn 5236/TCT-CS năm 2019 do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT), trong đó tập trung làm rõ các quy định về điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư, đặc biệt là các dự án thuộc ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện.

Căn cứ pháp lý áp dụng

Văn bản căn cứ vào các quy định pháp luật về thuế GTGT và đầu tư tại thời điểm ban hành, bao gồm:

• Luật Thuế giá trị gia tăng số 13/2008/QH12 đã được sửa đổi, bổ sung một số điều theo Luật số 106/2016/QH13.
• Nghị định số 100/2016/NĐ-CP ngày 01/7/2016 của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật Quản lý thuế.
• Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính hướng dẫn nghị định số 100/2016/NĐ-CP.

Quy định về hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế, việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh được thực hiện theo nguyên tắc:

• Cơ sở kinh doanh đang hoạt động nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới tại cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thì phải thực hiện bù trừ số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư với thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào dùng cho dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.

Trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư có điều kiện

Tổng cục Thuế lưu ý các trường hợp dự án đầu tư không được hoàn thuế GTGT mà phải kết chuyển số thuế chưa được khấu trừ của dự án đầu tư sang kỳ tiếp theo:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp giấy phép kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện hoặc giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh.
• Dự án đầu tư chưa được cấp văn bản chấp thuận hoặc chưa đáp ứng đầy đủ các điều kiện về đầu tư kinh doanh theo quy định của pháp luật về đầu tư.
• Dự án đầu tư không đáp ứng đủ điều kiện về vốn điều lệ tối thiểu hoặc các điều kiện đặc thù khác theo quy định của pháp luật chuyên ngành.

Hướng dẫn tổ chức thực hiện cho Cục Thuế địa phương

Để đảm bảo việc thực thi chính sách thuế đúng quy định pháp luật, Tổng cục Thuế yêu cầu các Cục Thuế địa phương thực hiện:

• Tiến hành thanh tra, kiểm tra và rà soát thực tế hồ sơ dự án đầu tư của người nộp thuế trên địa bàn quản lý.
• Xác định rõ dự án đầu tư của doanh nghiệp có thuộc danh mục ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện hay không.
• Đối chiếu tiến độ thực hiện dự án, việc cấp các giấy phép con, giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh của doanh nghiệp để quyết định việc hoàn thuế GTGT hoặc kết chuyển khấu trừ theo đúng quy định.