Công văn 4560/TCT-KK được Tổng cục Thuế ban hành năm 2016 nhằm hướng dẫn và giải quyết các vướng mắc liên quan đến công tác hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT). Đây là văn bản chỉ đạo quan trọng giúp các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thống nhất quy trình thực hiện, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế đồng thời tăng cường quản lý, phòng chống gian lận trong hoàn thuế GTGT.

Phân loại và xử lý hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng

Công văn tập trung hướng dẫn việc phân loại hồ sơ hoàn thuế nhằm tối ưu hóa quy trình kiểm tra và rút ngắn thời gian giải quyết cho doanh nghiệp:

• Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau: Áp dụng đối với các doanh nghiệp có lịch sử tuân thủ pháp luật thuế tốt, không có dấu hiệu rủi ro cao về thuế. Quá trình giải quyết hồ sơ được thực hiện nhanh chóng dựa trên thông tin tự khai, tự chịu trách nhiệm của doanh nghiệp.
• Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau: Áp dụng đối với các trường hợp có dấu hiệu rủi ro cao, doanh nghiệp mới thành lập dưới 12 tháng, doanh nghiệp có giao dịch đáng ngờ hoặc thuộc các ngành nghề có nguy cơ gian lận thuế cao. Cơ quan thuế sẽ tiến hành thanh tra, kiểm tra thực tế tại trụ sở người nộp thuế trước khi ban hành quyết định hoàn thuế.

Tăng cường công tác kiểm tra, giám sát và quản lý rủi ro

Để nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước và bảo vệ ngân sách, Tổng cục Thuế yêu cầu các cơ quan thuế địa phương thực hiện nghiêm túc các biện pháp sau:

• Thực hiện đối chiếu, kiểm tra kỹ lưỡng hóa đơn mua vào, bán ra để xác định tính xác thực của dòng tiền và hàng hóa giao dịch thực tế.
• Phối hợp chặt chẽ với các cơ quan chức năng liên quan như cơ quan Hải quan, Ngân hàng thương mại và cơ quan Công an để xác minh các giao dịch xuất khẩu, chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với các hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp xuất khẩu.
• Áp dụng triệt để hệ thống quản lý rủi ro tự động để phân tích, đánh giá và phát hiện sớm các doanh nghiệp có dấu hiệu mua bán hóa đơn bất hợp pháp nhằm trục lợi tiền hoàn thuế.

Trách nhiệm và thời hạn giải quyết của cơ quan thuế

Công văn nhấn mạnh vai trò chỉ đạo và trách nhiệm của thủ trưởng cơ quan thuế các cấp trong việc giám sát quy trình hoàn thuế:

• Đảm bảo giải quyết hồ sơ hoàn thuế đúng thời hạn quy định của Luật Quản lý thuế, tránh gây phiền hà, kéo dài thời gian hoặc gây khó khăn cho doanh nghiệp hoạt động sản xuất kinh doanh lành mạnh.
• Xử lý nghiêm các cán bộ, công chức thuế có hành vi nhũng nhiễu, chậm trễ trong việc tiếp nhận và xử lý hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế mà không có lý do chính đáng.
• Thực hiện chế độ báo cáo định kỳ về kết quả hoàn thuế GTGT, cũng như các trường hợp phát hiện gian lận về Tổng cục Thuế để kịp thời tổng hợp và đưa ra các biện pháp xử lý thống nhất trên phạm vi toàn quốc.