Công văn 413/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản chỉ đạo quan trọng nhằm tăng cường công tác quản lý, kiểm tra và giám sát quá trình hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT). Văn bản hướng dẫn các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thực hiện thống nhất các biện pháp nghiệp vụ nhằm đảm bảo việc hoàn thuế đúng đối tượng, đúng quy định pháp luật, đồng thời ngăn chặn các hành vi gian lận, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Phân loại hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng

Công văn nhấn mạnh việc áp dụng nguyên tắc quản lý rủi ro để phân loại hồ sơ hoàn thuế GTGT thành hai nhóm rõ rệt:

• Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau: Áp dụng đối với các doanh nghiệp có lịch sử tuân thủ pháp luật thuế tốt, không thuộc nhóm rủi ro cao về thuế và hóa đơn. Quá trình giải quyết hồ sơ được thực hiện nhanh chóng để tạo điều kiện lưu thông vốn cho doanh nghiệp.
• Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau: Áp dụng bắt buộc đối với các trường hợp có dấu hiệu rủi ro cao, doanh nghiệp mới thành lập dưới 12 tháng, doanh nghiệp có giao dịch liên kết phức tạp, hoặc các dự án đầu tư chưa có doanh thu nhưng có số thuế đề nghị hoàn lớn.

Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra trước và sau hoàn thuế

Để nâng cao hiệu quả quản lý, Tổng cục Thuế yêu cầu các cơ quan thuế địa phương tập trung vào các nội dung sau:

• Đối với hồ sơ kiểm tra trước hoàn: Thực hiện kiểm tra thực tế tại trụ sở người nộp thuế, đối chiếu kỹ lưỡng chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, tờ khai hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, và tính hợp pháp của các hóa đơn đầu vào.
• Đối với hồ sơ hoàn trước kiểm sau: Xây dựng kế hoạch thanh tra, kiểm tra sau hoàn thuế theo đúng thời hạn quy định. Tập trung đối chiếu, xác minh hóa đơn mua vào từ các doanh nghiệp trung gian nhằm phát hiện kịp thời các hành vi mua bán hóa đơn bất hợp pháp.

Phối hợp liên ngành trong công tác chống gian lận hoàn thuế

Công văn chỉ đạo việc tăng cường phối hợp chặt chẽ giữa cơ quan thuế và các cơ quan chức năng khác:

• Phối hợp với cơ quan Hải quan: Xác minh thực tế hàng hóa xuất khẩu qua các cửa khẩu đường bộ, đường biển, kiểm tra tính xác thực của các tờ khai hải quan nhằm ngăn chặn tình trạng xuất khống hàng hóa để hoàn thuế.
• Phối hợp với cơ quan Công an: Chuyển hồ sơ sang cơ quan điều tra đối với các trường hợp phát hiện doanh nghiệp có dấu hiệu thành lập "doanh nghiệp ma" để mua bán hóa đơn GTGT khống, chiếm đoạt tiền hoàn thuế của Nhà nước.
• Phối hợp với Ngân hàng thương mại: Xác minh dòng tiền thanh toán qua ngân hàng để đảm bảo các giao dịch mua bán là có thật và tuân thủ đúng điều kiện hoàn thuế GTGT.

Trách nhiệm của cơ quan thuế và công chức thuế

Tổng cục Thuế quy định rõ trách nhiệm của từng cấp quản lý trong việc giải quyết hồ sơ hoàn thuế:

• Nâng cao trách nhiệm công vụ: Công chức được giao nhiệm vụ giải quyết hồ sơ hoàn thuế phải thực hiện đúng quy trình, thủ tục, không tự ý kéo dài thời gian giải quyết hồ sơ gây khó khăn cho doanh nghiệp.
• Xử lý nghiêm sai phạm: Thủ trưởng các đơn vị thuế chịu trách nhiệm toàn diện nếu để xảy ra tình trạng chậm trễ không có lý do chính đáng hoặc để xảy ra sai phạm, thất thoát ngân sách nhà nước trong quá trình hoàn thuế.