Tổng quan về Công văn 3880/TCT-KK năm 2020

Công văn 3880/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng dành cho Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương về việc quản lý thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án đầu tư bị chấm dứt hoạt động. Văn bản này giải quyết các vướng mắc thực tế liên quan đến việc xử lý số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết, việc hoàn thuế và truy thu thuế đối với các dự án đầu tư không tiếp tục triển khai hoặc bị thu hồi giấy phép.

- Nguyên tắc xử lý thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chấm dứt hoạt động

Tổng cục Thuế hướng dẫn cụ thể về việc xử lý số thuế GTGT đầu vào lũy kế chưa được khấu trừ hết của dự án đầu tư tại thời điểm chấm dứt hoạt động như sau:

• Không được hoàn thuế theo diện dự án đầu tư: Kể từ thời điểm có quyết định chấm dứt hoạt động dự án đầu tư của cơ quan có thẩm quyền, dự án đó không còn thuộc đối tượng được hoàn thuế GTGT theo quy định dành cho dự án đầu tư đang trong giai đoạn chuẩn bị sản xuất kinh doanh.
• Chuyển nghĩa vụ thuế về trụ sở chính: Đối với dự án đầu tư của chi nhánh hoặc đơn vị phụ thuộc trực thuộc doanh nghiệp, khi dự án đầu tư chấm dứt hoạt động, số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết sẽ được kê khai bàn giao về cho trụ sở chính của doanh nghiệp để tiếp tục bù trừ, khấu trừ vào hoạt động sản xuất kinh doanh chung của doanh nghiệp.
• Xử lý khi doanh nghiệp giải thể hoặc phá sản: Trường hợp dự án đầu tư chấm dứt hoạt động dẫn đến việc doanh nghiệp phải giải thể hoặc phá sản, số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết sẽ được xử lý theo quy định của pháp luật về hoàn thuế GTGT đối với doanh nghiệp giải thể, phá sản, chấm dứt hoạt động.

- Quy định về việc truy thu thuế GTGT đã hoàn

Một trong những nội dung cốt lõi của Công văn 3880/TCT-KK là việc xác định trách nhiệm hoàn trả ngân sách nhà nước đối với số thuế GTGT đã được hoàn trước đó của dự án đầu tư bị chấm dứt:

• Trường hợp phải thu hồi thuế đã hoàn: Nếu dự án đầu tư đã được cơ quan thuế giải quyết hoàn thuế GTGT trong giai đoạn đầu tư, nhưng sau đó dự án bị chấm dứt hoạt động mà không đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh, không phát sinh doanh thu đầu ra chịu thuế GTGT, thì doanh nghiệp phải có trách nhiệm nộp lại số tiền thuế GTGT đã được hoàn vào ngân sách nhà nước.
• Xử lý tiền chậm nộp: Doanh nghiệp phải tự kê khai, nộp lại số thuế đã hoàn. Trường hợp cơ quan thuế qua thanh tra, kiểm tra phát hiện doanh nghiệp không tự giác nộp lại, cơ quan thuế sẽ ban hành quyết định thu hồi tiền hoàn thuế GTGT và tính tiền chậm nộp kể từ ngày doanh nghiệp nhận được tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước đến ngày thực nộp lại tiền thuế.
• Xem xét các trường hợp bất khả kháng: Đối với các dự án đầu tư phải chấm dứt hoạt động do các nguyên nhân bất khả kháng như thiên tai, dịch bệnh, hỏa hoạn hoặc do các nguyên nhân khách quan ngoài tầm kiểm soát của doanh nghiệp, cơ quan thuế sẽ phối hợp với các cơ quan chức năng liên quan để xem xét, báo cáo cấp có thẩm quyền quyết định phương án xử lý thuế phù hợp, không áp dụng biện pháp truy thu cứng nhắc nếu doanh nghiệp chứng minh được thiệt hại thực tế.

- Trách nhiệm của Cơ quan thuế trong công tác quản lý

Để đảm bảo quản lý chặt chẽ nguồn thu ngân sách và tránh thất thoát thuế, Tổng cục Thuế yêu cầu các cơ quan thuế địa phương thực hiện các biện pháp sau:

• Tăng cường phối hợp liên ngành: Chủ động phối hợp với Sở Kế hoạch và Đầu tư, Ban Quản lý Khu công nghiệp, Khu chế xuất để cập nhật kịp thời danh sách các dự án đầu tư bị thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc quyết định chấm dứt hoạt động.
• Đẩy mạnh thanh tra, kiểm tra sau hoàn thuế: Tập trung thanh tra, kiểm tra đối với các doanh nghiệp có dự án đầu tư phát sinh số thuế hoàn lớn nhưng chậm tiến độ, có dấu hiệu ngừng hoạt động hoặc chuyển nhượng dự án để kịp thời phát hiện và xử lý các hành vi trục lợi chính sách hoàn thuế.
• Hướng dẫn và hỗ trợ người nộp thuế: Hướng dẫn chi tiết cho doanh nghiệp về hồ sơ, thủ tục kê khai điều chỉnh thuế GTGT, thủ tục bàn giao số thuế GTGT đầu vào từ dự án đầu tư về trụ sở chính khi dự án chấm dứt hoạt động nhằm đảm bảo quyền lợi hợp pháp cho doanh nghiệp.