Công văn 2385/TCT-CS được Tổng cục Thuế ban hành nhằm giải quyết các vướng mắc và hướng dẫn chi tiết về chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), đặc biệt là các quy định liên quan đến ưu đãi thuế đối với hoạt động sản xuất phần mềm và các điều kiện thực tế để doanh nghiệp được hưởng quyền lợi này.

• Ưu đãi thuế TNDN chỉ được áp dụng đối với các doanh nghiệp có dự án đầu tư mới thực tế thực hiện hoạt động sản xuất sản phẩm phần mềm thuộc danh mục sản phẩm phần mềm theo quy định của pháp luật về công nghệ thông tin.
• Các hoạt động mang tính chất thương mại thuần túy như mua bán, phân phối sản phẩm phần mềm do đơn vị khác sản xuất, hoặc các dịch vụ phần mềm không nằm trong quy trình sản xuất tiêu chuẩn sẽ không thuộc đối tượng được hưởng ưu đãi thuế TNDN theo diện sản xuất phần mềm.

• Doanh nghiệp phải chứng minh được quy trình sản xuất phần mềm của mình đáp ứng đầy đủ các công đoạn theo quy định của Bộ Thông tin và Truyền thông, bao gồm các bước cốt lõi như thiết kế, lập trình, kiểm thử và đóng gói sản phẩm.
• Hồ sơ chứng minh hoạt động sản xuất phần mềm phải rõ ràng, minh bạch và sẵn sàng xuất trình khi cơ quan thuế thực hiện công tác thanh tra, kiểm tra tại doanh nghiệp.

• Doanh nghiệp có nhiều hoạt động sản xuất kinh doanh khác nhau bắt buộc phải hạch toán riêng khoản thu nhập từ hoạt động sản xuất sản phẩm phần mềm được hưởng ưu đãi thuế TNDN.
• Trong trường hợp doanh nghiệp không thể hạch toán riêng được khoản thu nhập ưu đãi này, phần thu nhập ưu đãi sẽ được xác định theo tỷ lệ giữa doanh thu của hoạt động sản xuất phần mềm trên tổng doanh thu thực tế của doanh nghiệp trong kỳ tính thuế.

• Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm căn cứ vào tình hình hoạt động thực tế của từng doanh nghiệp trên địa bàn để hướng dẫn thực hiện nghĩa vụ thuế đúng quy định.
• Cơ quan thuế địa phương cần tăng cường công tác giám sát, kiểm tra việc áp dụng ưu đãi thuế TNDN nhằm đảm bảo tính chính xác, ngăn chặn các hành vi lợi dụng chính sách ưu đãi để trốn thuế hoặc chuyển giá.