Công văn 2002/TCT-CS được ban hành bởi Tổng cục Thuế năm 2015 nhằm hướng dẫn và giải đáp các vướng mắc liên quan đến việc xác định giá tính thuế tài nguyên đối với nước thiên nhiên. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng dành cho các Cục Thuế địa phương và các doanh nghiệp khai thác, sử dụng tài nguyên nước thiên nhiên phục vụ cho hoạt động sản xuất, kinh doanh, đặc biệt là trong lĩnh vực phát điện.

Nguyên tắc xác định giá tính thuế tài nguyên nước thiên nhiên

• Giá tính thuế tài nguyên đối với nước thiên nhiên được xác định dựa trên giá bán đơn vị sản phẩm tài nguyên chưa bao gồm thuế giá trị gia tăng.
• Đối với nước thiên nhiên dùng cho sản xuất thủy điện, giá tính thuế tài nguyên là giá bán điện thương phẩm bình quân do cơ quan có thẩm quyền công bố hoặc phê duyệt tại thời điểm tính thuế.
• Trường hợp nước thiên nhiên được khai thác để sử dụng cho các mục đích khác như sản xuất nước sạch, kinh doanh dịch vụ, giá tính thuế được căn cứ vào biểu giá tính thuế tài nguyên do Ủy ban nhân dân cấp tỉnh ban hành tại địa phương nơi khai thác.

Thẩm quyền và trách nhiệm của các cơ quan liên quan

• Sở Tài chính chủ trì phối hợp: Có trách nhiệm phối hợp với Cục Thuế và các cơ quan liên quan để xây dựng, trình Ủy ban nhân dân cấp tỉnh ban hành Bảng giá tính thuế tài nguyên sát với giá thị trường và phù hợp với khung giá do Bộ Tài chính quy định.
• Cục Thuế địa phương: Thực hiện kiểm tra, giám sát việc kê khai, nộp thuế tài nguyên của các tổ chức, cá nhân khai thác nước thiên nhiên; kịp thời phát hiện các trường hợp áp dụng sai giá tính thuế để thực hiện truy thu hoặc xử lý theo quy định của pháp luật quản lý thuế.
• Người nộp thuế: Có trách nhiệm tự kê khai, tự tính và nộp thuế tài nguyên nước thiên nhiên theo đúng sản lượng khai thác thực tế và giá tính thuế quy định tại Bảng giá của địa phương hoặc theo hướng dẫn cụ thể của cơ quan thuế trực tiếp quản lý.

Xử lý vướng mắc trong thực tế áp dụng

• Trong trường hợp giá bán tài nguyên nước thiên nhiên trên thị trường có biến động lớn hoặc phát sinh loại tài nguyên nước mới chưa được quy định trong Bảng giá của địa phương, Cục Thuế có trách nhiệm báo cáo Ủy ban nhân dân tỉnh để chỉ đạo Sở Tài chính kịp thời điều chỉnh, bổ sung.
• Đối với các trường hợp đặc thù khi doanh nghiệp tự khai thác nước thiên nhiên phục vụ cho hoạt động sản xuất khép kín, không có giá bán thương mại trực tiếp, giá tính thuế sẽ được xác định theo giá quy đổi hoặc áp dụng theo khung giá tối thiểu do Bộ Tài chính ban hành.