Kính gửi: Các Cục Hải quan tỉnh, thành phố.

Tổng cục Hải quan nhận được báo cáo vướng mắc về việc thực hiện Hệ thống miễn thuế, giảm thuế, hoàn thuế, không thu thuế, xử lý tiền thuế nộp thừa (Hệ thống MGH) của một số Cục Hải quan tỉnh, thành phố. Về vấn đề này, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

1. Vướng mắc về xử lý hồ sơ trong trường hợp người nộp thuế gửi sai đơn vị hải quan có thẩm quyền xử lý; sai phân hệ; sai đối tượng hoàn thuế, không thu thuế, xử lý tiền thuế nộp thừa

Về yêu cầu hỗ trợ thanh khoản các hồ sơ còn treo trên Hệ thống MGH: Trước mắt, khi Hệ thống chưa được nâng cấp, yêu cầu các đơn vị không tiến hành xóa/hủy hồ sơ trên Hệ thống MGH; lập danh sách theo dõi riêng đối với các hồ sơ bị treo để phục vụ công tác báo cáo, thống kê, hỗ trợ thanh khoản sau khi Hệ thống được nâng cấp.

Lý do: Mỗi hồ sơ khi gửi lên Hệ thống MGH sẽ được tự động cấp số hồ sơ, mỗi hồ sơ là duy nhất. Do đó, việc xóa/hủy hồ sơ trên Hệ thống tuy giúp thanh khoản hồ sơ còn treo/ tồn nhưng có nhược điểm là dẫn đến việc trống số thứ tự đã cấp, không có lịch sử xử lý.

2. Kiến nghị thiết lập bổ sung trên Hệ thống MGH trường hợp “không thu thuế đối với hàng hóa thuộc đối tượng hoàn thuế” nhưng chưa nộp thuế theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 37a Nghị định số 134/2016/NĐ-CP ngày 01/9/2016 của Chính phủ được bổ sung tại khoản 19 Điều 1 Nghị định số 18/2021/NĐ-CP ngày 11/3/2021 của Chính phủ (Cục HQ tỉnh Đồng Nai)

Theo thiết kế phân hệ “không thu thuế” trên Hệ thống MGH cho phép người nộp thuế gửi hồ sơ không thu thuế đến cơ quan hải quan trong 03 trường hợp sau:

a) Hồ sơ không thu thuế nhập khẩu/xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu/nhập khẩu tương ứng không phải nộp thuế;

b) Hồ sơ không thu thuế nhập khẩu/xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu/nhập khẩu tương ứng có phát sinh số tiền thuế đề nghị hoàn;

c) Hồ sơ không thu thuế nhập khẩu/xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu/nhập khẩu tương ứng phải nộp thuế nhưng chưa nộp thuế.

Yêu cầu các đơn vị hướng dẫn người nộp thuế khi nộp hồ sơ không thu thuế đối với trường hợp không thu thuế đối với hàng hóa thuộc đối tượng hoàn thuế nhưng chưa nộp thuế theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 37a Nghị định số 134/2016/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung tại khoản 19 Điều 1 Nghị định số 18/2021/NĐ-CP thì thực hiện:

- Trường hợp hồ sơ không thu thuế nhập khẩu có tờ khai xuất khẩu tương ứng phải nộp thuế nhưng chưa nộp thuế: người nộp thuế phải kê khai hồ sơ không thu thuế nhập khẩu trước sau đó tiếp tục kê khai hồ sơ không thu thuế xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu tương ứng chưa nộp thuế và tại chỉ tiêu trường hợp không thu thuế chọn “Hồ sơ không thu thuế nhập khẩu/xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu/nhập khẩu tương ứng phải nộp thuế nhưng chưa nộp thuế”.

- Trường hợp hồ sơ không thu thuế xuất khẩu có tờ khai nhập khẩu tương ứng phải nộp thuế như chưa nộp thuế: người nộp thuế phải kê khai hồ sơ không thu thuế xuất khẩu trước sau đó tiếp tục kê khai hồ sơ không thu thuế nhập khẩu có tờ khai nhập khẩu tương ứng chưa nộp thuế và tại chỉ tiêu trường hợp không thu thuế chọn “Hồ sơ không thu thuế nhập khẩu/xuất khẩu có tờ khai xuất khẩu/nhập khẩu tương ứng phải nộp thuế nhưng chưa nộp thuế”.

3. Kiến nghị nâng cấp Hệ thống MGH

Tổng cục Hải quan ghi nhận đề xuất của Cục HQ TP Đà Nẵng, Cục HQ TP Hồ Chí Minh, Cục HQ Đồng Nai, Cục HQ Thừa Thiên Huế, Cục HQ Quảng Ninh, Cục HQ Long An, Cục HQ tỉnh Cần Thơ, Cục HQ tỉnh An Giang để rà soát tổng thể các chức năng, bài toán nghiệp vụ, nâng cấp Hệ thống đảm bảo việc tổ chức thực hiện, cụ thể:

a) Nâng cấp chức năng Báo cáo - thống kê theo hướng báo cáo theo ngày xử lý hồ sơ để tránh nhầm lẫn khi thực hiện các báo cáo và kiểm soát được các hồ sơ tồn đọng trên Hệ thống MGH (Cục HQ TP Đà Nẵng).

b) Bổ sung chứng năng phân hệ miễn thuế (Cục HQ TP Hồ Chí Minh):

- Bổ sung chứng năng thống kê, theo dõi hàng hóa nhập khẩu miễn thuế phát sinh thuộc danh mục miễn thuế trên Hệ thống MGH để cơ quan hải quan nơi tiếp nhận danh mục miễn thuế quản lý, theo danh mục.

- Bổ sung chức năng cho phép chủ dự án nộp báo cáo tình hình sử dụng hàng hóa miễn thuế hàng năm thông qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử.

c) Nâng cấp đồng bộ thông tin của tờ khai sửa vào nội dung đề nghị không thu thuế trên Hệ thống MGH trong trường hợp doanh nghiệp khai sửa đổi, bổ sung các chỉ tiêu thông tin tờ khai sau thông quan trên hệ thống VNACCS (AMA/AMC) hoặc Hệ thống Dịch vụ công trực tuyến (Cục HQ tỉnh Cần Thơ).

d) Cập nhật số tiền thuế được miễn của các loại thuế nhập khẩu bổ sung vào Hệ thống MGH, hiện nay phân hệ miễn thuế mới chỉ cập nhập số tiền thuế xuất khẩu, nhập khẩu được miễn từ Hệ thống VNACCS sang (Cục HQ tỉnh An Giang).

đ) Bổ sung chức năng xử lý tiếp hoặc trả lại hồ sơ đối với trường hợp hồ sơ cần giải trình/bổ sung nhưng quá thời hạn người nộp thuế không thực hiện bổ sung, giải trình; hồ sơ gửi sai đơn vị hải quan có thẩm quyền xử lý; hồ sơ gửi sai phân hệ, sai đối tượng hoàn thuế, không thu thuế, xử lý tiền thuế nộp thừa.

Tổng cục Hải quan thông báo để các Cục Hải quan tỉnh, thành phố biết và thực hiện./.