Tóm tắt Công văn 1065/TCT-CS năm 2016 về xác định mốc thời gian hưởng ưu đãi thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp

Công văn 1065/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2016 là văn bản hướng dẫn quan trọng dành cho các doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương trong việc xác định chính xác thời điểm bắt đầu áp dụng các chính sách ưu đãi về thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) cũng như thời gian miễn, giảm thuế đối với các dự án đầu tư.

- Nguyên tắc xác định mốc thời gian áp dụng thuế suất ưu đãi

• Thời gian áp dụng thuế suất ưu đãi đối với dự án đầu tư mới được tính liên tục từ năm đầu tiên doanh nghiệp có doanh thu từ dự án đầu tư được hưởng ưu đãi thuế.
• Doanh thu làm căn cứ xác định mốc thời gian này là doanh thu phát sinh thực tế từ hoạt động sản xuất, kinh doanh của dự án đầu tư, không phụ thuộc vào việc dự án đã có thu nhập chịu thuế hay chưa.
• Đối với các doanh nghiệp công nghệ cao, doanh nghiệp nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao, thời gian áp dụng thuế suất ưu đãi được tính từ năm được cấp Giấy chứng nhận doanh nghiệp công nghệ cao hoặc doanh nghiệp nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao.

- Nguyên tắc xác định mốc thời gian miễn thuế, giảm thuế TNDN

• Thời gian miễn thuế, giảm thuế đối với thu nhập từ dự án đầu tư mới được tính liên tục từ năm đầu tiên doanh nghiệp có thu nhập chịu thuế từ dự án đầu tư được hưởng ưu đãi thuế.
• Trường hợp doanh nghiệp không có thu nhập chịu thuế trong ba năm đầu, kể từ năm đầu tiên có doanh thu từ dự án đầu tư thì thời gian miễn thuế, giảm thuế được tính từ năm thứ tư kể từ năm đầu tiên phát sinh doanh thu.
• Việc xác định thu nhập chịu thuế để tính thời gian miễn, giảm thuế phải tuân thủ đúng quy định của pháp luật về thuế TNDN tại thời điểm phát sinh.

- Hướng dẫn xử lý đối với các trường hợp đặc thù

• Đối với các dự án đầu tư thực hiện theo nhiều giai đoạn hoặc có sự thay đổi về quy mô, doanh nghiệp cần phân bổ và xác định rõ phần doanh thu, thu nhập chịu thuế của từng giai đoạn để áp dụng mốc thời gian ưu đãi tương ứng.
• Trường hợp doanh nghiệp đang trong thời gian hưởng ưu đãi thuế TNDN nhưng có sự thay đổi về điều kiện ưu đãi (như thay đổi địa bàn, ngành nghề lĩnh vực ưu đãi), việc xác định ưu đãi cho thời gian còn lại phải căn cứ vào mức độ đáp ứng điều kiện thực tế tại thời điểm thay đổi.
• Các đơn vị trực thuộc, chi nhánh hạch toán phụ thuộc của doanh nghiệp nếu đáp ứng đủ điều kiện ưu đãi thuế độc lập thì được áp dụng mốc thời gian ưu đãi riêng theo dự án đầu tư của chi nhánh đó.

- Trách nhiệm của doanh nghiệp và cơ quan thuế

• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự xác định các điều kiện ưu đãi thuế, mức thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế và tự kê khai, quyết toán thuế với cơ quan thuế theo đúng quy định.
• Cơ quan thuế các cấp có trách nhiệm thanh tra, kiểm tra việc thực hiện nghĩa vụ thuế và áp dụng ưu đãi thuế của doanh nghiệp; trường hợp phát hiện doanh nghiệp xác định sai mốc thời gian hoặc không đủ điều kiện hưởng ưu đãi sẽ thực hiện truy thu và xử phạt theo quy định của pháp luật quản lý thuế.

Lưu ý: Nội dung hướng dẫn tại Công văn 1065/TCT-CS dựa trên hệ thống văn bản quy phạm pháp luật về thuế TNDN hiện hành tại thời điểm ban hành. Doanh nghiệp cần đối chiếu với các văn bản luật, nghị định và thông tư gốc để áp dụng chính xác cho từng kỳ tính thuế cụ thể.