Ngày 19 tháng 05 năm 2006, Tổng cục Thuế đã ban hành Công văn số 1760/TCT-PCCS hướng dẫn về việc trích khấu hao đối với quyền sử dụng đất có thời hạn. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc của doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương trong việc xác định chi phí hợp lý khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp liên quan đến tài sản cố định vô hình là quyền sử dụng đất.

Đối tượng áp dụng của công văn này bao gồm các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế đang sử dụng đất có thời hạn được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất hoặc nhận chuyển nhượng quyền sử dụng đất hợp pháp từ tổ chức, cá nhân khác, cùng các cơ quan thuế các cấp thực hiện công tác quản lý và thanh tra thuế.

• Quyền sử dụng đất có thời hạn được doanh nghiệp sử dụng vào hoạt động sản xuất, kinh doanh nếu đáp ứng đầy đủ các tiêu chuẩn về nguyên giá và thời gian sử dụng theo quy định của pháp luật về quản lý tài sản cố định thì được ghi nhận là tài sản cố định vô hình.
• Nguyên giá của tài sản cố định vô hình là quyền sử dụng đất được xác định bằng toàn bộ các chi phí thực tế mà doanh nghiệp đã chi ra để có quyền sử dụng đất hợp pháp. Các chi phí này bao gồm tiền trả cho tổ chức, cá nhân chuyển nhượng, tiền nộp vào ngân sách nhà nước, chi phí đền bù, giải phóng mặt bằng, lệ phí trước bạ và các chi phí trực tiếp khác liên quan trước khi đưa đất vào sử dụng.

• Doanh nghiệp được phép tính và trích khấu hao vào chi phí sản xuất, kinh doanh đối với quyền sử dụng đất có thời hạn. Thời gian trích khấu hao được xác định tương ứng với thời hạn được giao đất hoặc thời hạn sử dụng đất còn lại ghi trên Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất.
• Phương pháp trích khấu hao phải được thực hiện một cách nhất quán theo quy định của Bộ Tài chính về chế độ quản lý, sử dụng và trích khấu hao tài sản cố định hiện hành tại thời điểm áp dụng.
• Đối với quyền sử dụng đất lâu dài không xác định được thời hạn sử dụng, doanh nghiệp tuyệt đối không được trích khấu hao vào chi phí hợp lý khi xác định thuế thu nhập doanh nghiệp.

• Doanh nghiệp phải có đầy đủ hóa đơn, chứng từ hợp pháp chứng minh quyền sử dụng đất thuộc quyền sở hữu, quản lý của doanh nghiệp và đã hoàn thành các nghĩa vụ tài chính với Nhà nước hoặc bên chuyển nhượng theo đúng quy định của pháp luật.
• Quyền sử dụng đất phải được đưa vào sử dụng trực tiếp và có hiệu quả cho hoạt động sản xuất, kinh doanh của doanh nghiệp. Trường hợp đất để trống, không sử dụng hoặc sử dụng sai mục đích thì không được tính khấu hao vào chi phí được trừ.
• Doanh nghiệp phải thực hiện đăng ký phương pháp trích khấu hao tài sản cố định vô hình với cơ quan thuế trực tiếp quản lý trước khi thực hiện trích khấu hao để làm cơ sở giám sát, kiểm tra.

Công văn số 1760/TCT-PCCS có hiệu lực áp dụng kể từ ngày ban hành. Các hướng dẫn trong văn bản này là căn cứ pháp lý để các doanh nghiệp thực hiện đúng nghĩa vụ thuế, đồng thời giúp cơ quan thuế thống nhất phương án xử lý đối với các khoản chi phí khấu hao quyền sử dụng đất có thời hạn trên phạm vi cả nước.