Công văn số 3687/TM/KH-ĐT được Bộ Thương mại (nay là Bộ Công Thương) ban hành ngày 03/08/2004 hướng dẫn về việc bán thanh lý máy móc, thiết bị cũ đã hết khấu hao của các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) tại Việt Nam. Đây là văn bản quan trọng giải quyết các vướng mắc về thủ tục và nghĩa vụ thuế khi doanh nghiệp thực hiện thanh lý tài sản cố định là máy móc, thiết bị đã qua sử dụng.

Quy định về đối tượng và điều kiện thanh lý máy móc, thiết bị

• Áp dụng đối với các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài có nhu cầu thanh lý máy móc, thiết bị nhập khẩu tạo tài sản cố định đã hết thời gian khấu hao hoặc không còn nhu cầu sử dụng.
• Thiết bị, máy móc thanh lý phải đảm bảo các yêu cầu về an toàn lao động, vệ sinh môi trường theo quy định của pháp luật Việt Nam hiện hành trước khi bán ra thị trường nội địa.

Thủ tục thực hiện thanh lý tài sản

• Doanh nghiệp phải lập phương án thanh lý cụ thể, trong đó nêu rõ danh mục máy móc thiết bị cần thanh lý, nguồn gốc nhập khẩu, tình trạng khấu hao và lý do thanh lý.
• Nộp hồ sơ đề nghị thanh lý đến cơ quan quản lý đầu tư có thẩm quyền hoặc cơ quan hải quan giám sát trực tiếp để được xem xét và giải quyết theo đúng thẩm quyền.

Nghĩa vụ thuế và tài chính khi thanh lý

• Thuế nhập khẩu: Đối với máy móc, thiết bị trước đây được miễn thuế nhập khẩu để tạo tài sản cố định, khi thanh lý bán ra thị trường nội địa, doanh nghiệp phải thực hiện kê khai và nộp thuế nhập khẩu theo quy định tại thời điểm chuyển đổi mục đích sử dụng (trừ các trường hợp được miễn, giảm theo quy định đặc thù).
• Thuế giá trị gia tăng (GTGT): Doanh nghiệp phải xuất hóa đơn GTGT và nộp thuế GTGT đối với doanh thu phát sinh từ hoạt động bán thanh lý máy móc, thiết bị cũ theo thuế suất quy định.
• Thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Khoản thu nhập từ việc thanh lý tài sản sau khi trừ đi giá trị còn lại (nếu có) và các chi phí thanh lý liên quan sẽ được tính vào thu nhập khác để xác định thuế TNDN phải nộp.

Trách nhiệm của doanh nghiệp và cơ quan quản lý

• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của thông tin khai báo, tình trạng kỹ thuật và môi trường của máy móc thiết bị thanh lý.
• Các cơ quan chức năng như Hải quan, Thuế và cơ quan quản lý đầu tư địa phương có trách nhiệm phối hợp kiểm tra, giám sát quá trình thanh lý nhằm đảm bảo đúng quy định pháp luật, tránh thất thu ngân sách nhà nước.