Công văn số 31/TCT-CS được ban hành bởi Tổng cục Thuế nhằm hướng dẫn chi tiết về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản, hải sản chưa chế biến thành các sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân, doanh nghiệp và hợp tác xã có hoạt động sản xuất, kinh doanh, thương mại các mặt hàng nông sản, lâm sản, thủy hải sản trên phạm vi cả nước. Quy định tập trung làm rõ nghĩa vụ thuế GTGT phát sinh tại từng khâu từ sản xuất đến lưu thông thương mại.

Nội dung quy định cốt lõi về thuế giá trị gia tăng

Tổng cục Thuế đưa ra các hướng dẫn cụ thể về việc xác định đối tượng chịu thuế, không chịu thuế và các trường hợp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT như sau:

• Khâu trực tiếp sản xuất bán ra: Sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản, hải sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành các sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường do tổ chức, cá nhân tự sản xuất, đánh bắt bán ra thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Khâu kinh doanh thương mại giữa các doanh nghiệp, hợp tác xã: Doanh nghiệp, hợp tác xã nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ khi bán các sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản chưa chế biến hoặc mới chỉ qua sơ chế thông thường cho doanh nghiệp, hợp tác xã khác ở khâu kinh doanh thương mại thì không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT. Trên hóa đơn GTGT, dòng thuế suất và tiền thuế GTGT không ghi và phải gạch chéo.
• Khâu bán lẻ cho các đối tượng khác: Trường hợp doanh nghiệp, hợp tác xã bán sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản chưa chế biến hoặc mới chỉ qua sơ chế thông thường cho hộ, cá nhân kinh doanh và các tổ chức, cá nhân khác không phải là doanh nghiệp, hợp tác xã thì phải kê khai, tính nộp thuế GTGT theo mức thuế suất là 5%.
• Áp dụng đối với phương pháp tính trực tiếp: Hộ, cá nhân kinh doanh, doanh nghiệp, hợp tác xã nộp thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp trên giá trị gia tăng khi bán sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản ở khâu kinh doanh thương mại thì phải kê khai, nộp thuế GTGT theo tỷ lệ 1% trên doanh thu.
• Nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đầu vào: Cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ mua sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản thuộc trường hợp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT đầu ra vẫn được khấu trừ thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ cho khâu này nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện về hóa đơn, chứng từ thanh toán theo quy định.

Hiệu lực thi hành và hướng dẫn thực hiện

Công văn số 31/TCT-CS được áp dụng thống nhất cùng với các văn bản quy phạm pháp luật về thuế GTGT hiện hành (đặc biệt là Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính). Tổng cục Thuế yêu cầu Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương căn cứ vào hướng dẫn này để triển khai, tuyên truyền và hướng dẫn người nộp thuế trên địa bàn thực hiện đúng quy định pháp luật.