Công văn số 2341/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về chứng từ nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng hóa nhập khẩu. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp các doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương thống nhất cách xác định chứng từ hợp pháp để thực hiện kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào ở khâu nhập khẩu.

Nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu

Theo quy định pháp luật về thuế giá trị gia tăng, để được khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa nhập khẩu, cơ sở kinh doanh cần đáp ứng các điều kiện cơ bản sau:

• Phải có chứng từ nộp thuế giá trị gia tăng ở khâu nhập khẩu hợp pháp. Chứng từ này là minh chứng bằng văn bản thể hiện doanh nghiệp đã hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế vào Ngân sách Nhà nước.
• Phải có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa nhập khẩu có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên theo quy định của pháp luật (trừ các trường hợp đặc biệt được miễn trừ).
• Hàng hóa, dịch vụ nhập khẩu phải được sử dụng vào mục đích sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT.

Các loại chứng từ nộp thuế GTGT hàng nhập khẩu hợp lệ

Văn bản làm rõ các loại chứng từ được chấp nhận để làm căn cứ kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào bao gồm:

• Giấy nộp tiền vào Ngân sách Nhà nước: Chứng từ chứng minh doanh nghiệp đã thực hiện nộp tiền thuế GTGT khâu nhập khẩu bằng hình thức chuyển khoản hoặc nộp tiền mặt vào kho bạc nhà nước thông qua ngân hàng thương mại.
• Biên lai nộp thuế: Chứng từ do cơ quan hải quan hoặc cơ quan có thẩm quyền cấp cho doanh nghiệp khi thực hiện nộp thuế trực tiếp tại cửa khẩu hoặc chi cục hải quan quản lý.
• Chứng từ nộp thuế điện tử: Các chứng từ nộp thuế được hệ thống thông tin của Tổng cục Hải quan hoặc Ngân hàng thương mại xác nhận bằng chữ ký số, có giá trị pháp lý tương đương chứng từ giấy.

Lưu ý quan trọng đối với doanh nghiệp khi thực hiện kê khai

Để đảm bảo tính hợp pháp và tránh bị cơ quan thuế từ chối khấu trừ khi thanh tra, kiểm tra, doanh nghiệp cần lưu ý các điểm sau:

• Thông tin trên chứng từ nộp thuế (như tên người nộp thuế, mã số thuế, số tờ khai hải quan, số tiền thuế) phải hoàn toàn trùng khớp với thông tin trên tờ khai hải quan nhập khẩu và các chứng từ thương mại liên quan.
• Trường hợp doanh nghiệp ủy thác nhập khẩu, chứng từ nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu phải mang tên tổ chức nhận ủy thác, kèm theo hóa đơn GTGT trả hàng ủy thác nhập khẩu của bên nhận ủy thác xuất cho bên ủy thác.
• Doanh nghiệp cần chủ động đối chiếu, lưu trữ chứng từ nộp thuế cùng với hồ sơ hải quan để phục vụ công tác quyết toán thuế định kỳ.