Công văn số 2105 TCT/NV4 được ban hành ngày 12/06/2003 bởi Tổng cục Thuế - Bộ Tài chính nhằm hướng dẫn công tác quản lý thuế đối với khoản thu thủy lợi phí. Đây là văn bản quan trọng điều chỉnh nghĩa vụ thuế và quản lý tài chính đối với các đơn vị khai thác công trình thủy lợi.

Đối tượng áp dụng và phạm vi điều chỉnh

• Các doanh nghiệp nhà nước hoạt động trong lĩnh vực quản lý và khai thác công trình thủy lợi.
• Các hợp tác xã dịch vụ nông nghiệp, tổ chức, cá nhân có hoạt động thu thủy lợi phí phục vụ tưới tiêu, sản xuất nông nghiệp.
• Các cơ quan thuế địa phương chịu trách nhiệm đôn đốc, kiểm tra và quản lý thu thuế đối với hoạt động này.

Chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với thủy lợi phí

• Dịch vụ tưới nước, tiêu nước phục vụ sản xuất nông nghiệp thuộc đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng (GTGT) theo quy định của pháp luật về thuế GTGT thời kỳ này.
• Đối với các hoạt động dịch vụ khác ngoài tưới tiêu nông nghiệp (như cung cấp nước cho sản xuất công nghiệp, sinh hoạt, phát điện), đơn vị phải thực hiện kê khai và nộp thuế GTGT theo thuế suất quy định hiện hành.
• Quy định về việc sử dụng hóa đơn, chứng từ: Các đơn vị khi thu tiền thủy lợi phí phải lập hóa đơn, chứng từ theo đúng quy định của Bộ Tài chính để làm cơ sở theo dõi, hạch toán doanh thu.

Chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN)

• Doanh thu từ hoạt động cung cấp dịch vụ thủy lợi phí phục vụ nông nghiệp được hạch toán vào doanh thu của đơn vị để xác định kết quả kinh doanh.
• Các khoản chi phí hợp lý, hợp lệ liên quan trực tiếp đến việc quản lý, vận hành và khai thác công trình thủy lợi được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN.
• Trường hợp đơn vị nhận được kinh phí cấp bù thủy lợi phí từ ngân sách nhà nước, khoản kinh phí này phải được quản lý, sử dụng và quyết toán đúng mục đích, đúng chế độ tài chính hiện hành.

Công tác quản lý, kê khai và nộp thuế

• Các đơn vị có trách nhiệm mở sổ sách kế toán, ghi chép đầy đủ các khoản thu thủy lợi phí và các khoản chi phí phát sinh theo chế độ kế toán hiện hành.
• Thực hiện kê khai thuế định kỳ đầy đủ, chính xác với cơ quan thuế trực tiếp quản lý, đảm bảo tính minh bạch trong việc sử dụng nguồn thu từ thủy lợi phí.
• Cơ quan thuế địa phương có trách nhiệm hướng dẫn, kiểm tra, giám sát chặt chẽ việc thực hiện nghĩa vụ thuế của các đơn vị, xử lý nghiêm các trường hợp vi phạm theo quy định của pháp luật.