Giới thiệu về Công văn 996/TCT-CS năm 2025

Công văn 996/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2025 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến việc xác định ngành nghề ưu đãi đầu tư. Văn bản này làm cơ sở để các doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương áp dụng đúng, đủ các chính sách ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) theo quy định của pháp luật hiện hành.

Các nguyên tắc cốt lõi trong xác định ngành nghề ưu đãi đầu tư

Theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế, việc xác định một dự án đầu tư có thuộc đối tượng được hưởng ưu đãi thuế hay không phải tuân thủ các nguyên tắc pháp lý chặt chẽ sau:

• Sự đồng bộ giữa pháp luật đầu tư và pháp luật thuế: Ngành nghề ưu đãi đầu tư phải được đối chiếu đồng thời giữa quy định của Luật Đầu tư (về danh mục ngành nghề ưu đãi, địa bàn ưu đãi) và quy định của Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp tại thời điểm dự án bắt đầu phát sinh doanh thu hoặc đi vào hoạt động.
• Căn cứ vào hồ sơ pháp lý của dự án: Cơ quan thuế thực hiện xác định ưu đãi dựa trên Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, quyết định chủ trương đầu tư hoặc các văn bản chấp thuận đầu tư do cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp.
• Thực tế hoạt động sản xuất kinh doanh: Ưu đãi thuế chỉ áp dụng đối với phần thu nhập thực tế phát sinh từ hoạt động đầu tư thuộc ngành nghề được ưu đãi. Doanh nghiệp không được áp dụng ưu đãi chung cho toàn bộ kết quả kinh doanh nếu có phát sinh thu nhập từ các hoạt động ngoài danh mục ưu đãi.

Quy định về hạch toán và nghĩa vụ của người nộp thuế

Để đảm bảo tính minh bạch và tuân thủ pháp luật, Công văn đưa ra các yêu cầu cụ thể đối với doanh nghiệp trong quá trình thụ hưởng ưu đãi:

• Nghĩa vụ hạch toán riêng: Doanh nghiệp có trách nhiệm hạch toán riêng khoản thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh được hưởng ưu đãi thuế TNDN. Trường hợp không hạch toán riêng được, phần thu nhập ưu đãi được xác định theo tỷ lệ doanh thu hoặc tỷ lệ chi phí hợp lý giữa hoạt động ưu đãi và hoạt động không ưu đãi.
• Nguyên tắc tự khai, tự chịu trách nhiệm: Người nộp thuế tự xác định các điều kiện ưu đãi, mức thuế suất ưu đãi, thời hạn miễn thuế, giảm thuế và tự kê khai vào hồ sơ quyết toán thuế TNDN hàng năm.
• Công tác hậu kiểm của cơ quan thuế: Cơ quan thuế các cấp sẽ tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra sau quyết toán để rà soát tính chính xác của việc áp dụng ngành nghề ưu đãi, đảm bảo không thất thoát ngân sách nhà nước.

Ý nghĩa thực tiễn của văn bản

Công văn 996/TCT-CS năm 2025 đóng vai trò là kim chỉ nam giúp tháo gỡ các điểm nghẽn trong việc phân loại ngành nghề đầu tư thực tế của doanh nghiệp so với danh mục khuyến khích đầu tư của Nhà nước. Việc hướng dẫn rõ ràng này giúp doanh nghiệp chủ động tối ưu hóa chi phí thuế, đồng thời tạo môi trường đầu tư minh bạch, nhất quán tại các địa phương.